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[新手求助] 两个自由基之间反应的过渡态自旋多重度如何判断?

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本帖最后由 Kikyou 于 2020-6-28 15:04 编辑

我想寻找两个自由基通过氢原子转移生成两个自旋多重度为1的物种的过程的过渡态
然后自旋多重度这里不知道怎么设置了
初始的俩自由基都是自旋多重度为2,生成的俩产物都是自旋多重度为1
我猜测过渡态的自旋多重度可能为1或者3
然后我分别找了单重态和三重态的过渡态,以及单重态时对称破缺的过渡态
又分别做了波函数稳定性检测,发现S=3和对称破缺的单重态都是稳定的,单重态是不稳定的
这我就不知道该怎么处理了,是选两个稳定的里面能量最低的还是说这俩都是合理,路径上是两个过渡态呢
或者说我的处理方式有问题?
新手刚学,请多多指教!谢谢各位~


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发表于 Post on 2020-6-27 00:08:03 | 只看该作者 Only view this author
(1)S不是自旋多重度,2S+1才是,注意表述要严谨。S=1指的是三重态。
(2)波函数不稳定 就继续优化至稳定(先用stable=opt优化波函数至稳定,再做结构优化,最后再检测波函数稳定性),别停着不往下走了哇。
最后算出来谁能量低就取谁。若能量很接近就要考虑自旋交叉、两态反应性类似的问题了。
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发表于 Post on 2020-6-27 01:12:01 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 喵星大佬 于 2020-6-27 02:19 编辑

反应前两个三重态的原料,反应后两个单重态的产物,过渡态总自旋应该为0,但是自旋密度并不是处处为0的,所以不是单重态而是自旋极化单重态。

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2020-6-27 10:23:22 | 只看该作者 Only view this author
zjxitcc 发表于 2020-6-27 00:08
(1)S不是自旋多重度,2S+1才是,注意表述要严谨。S=1指的是三重态。
(2)波函数不稳定 就继续优化至稳 ...

好的,我知道了,谢谢您!

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2020-6-27 10:36:06 | 只看该作者 Only view this author
zjxitcc 发表于 2020-6-27 00:08
(1)S不是自旋多重度,2S+1才是,注意表述要严谨。S=1指的是三重态。
(2)波函数不稳定 就继续优化至稳 ...

您好,我还想再请教一下,我对单重态的不稳定的波函数进行优化时,提示The wavefunction has an RHF -> UHF instability.是不是就是说优化时就开始做对称破缺了,这是不是和自旋极化单重态的结果一样?(这个优化稳定后得到的Mulliken自旋布居的最大值和最小值分别是0.268686和-0.308796)

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发表于 Post on 2020-6-27 11:15:02 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 zjxitcc 于 2020-6-27 11:16 编辑

看你用的关键词,如果你只写了stable,那么到提示The wavefunction has an RHF -> UHF instability后面没有啥有效信息了,这个关键词只能检测稳定性,不管稳不稳定都会结束任务。

如果你写的是stable=opt,提示The wavefunction has an RHF -> UHF instability后就会自动优化波函数直至稳定为止。看最后一处SCF Done即可看出能量降低了多少,自旋是多少(普通泛函看这个。双杂化泛函不是看SCF Done)。

与“自旋极化单重态的结果一样”语意不对,这就是在算自旋极化单重态,而不是与之一样(仿佛在强调是2个东西)。

PS:告诉我什么“Mulliken自旋布居的最大值和最小值”并没有什么用处。
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2020-6-27 13:49:04 | 只看该作者 Only view this author
zjxitcc 发表于 2020-6-27 11:15
看你用的关键词,如果你只写了stable,那么到提示The wavefunction has an RHF -> UHF instability后面没有 ...

嗯嗯好的,我知道啦,谢谢!

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发表于 Post on 2020-6-27 14:07:13 | 只看该作者 Only view this author
经验上来看,你反应物是开壳层,产物是闭壳层的情况下,过渡态在开壳层情况下搜寻似乎更为合理

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发表于 Post on 2021-12-24 10:04:06 | 只看该作者 Only view this author
您好!请问“单重态时对称破缺的过渡态”是怎么计算的?用什么软件?关键词是什么?谢谢!

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发表于 Post on 2021-12-24 10:16:52 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 zjxitcc 于 2021-12-24 10:18 编辑
ABQTrap 发表于 2021-12-24 10:04
您好!请问“单重态时对称破缺的过渡态”是怎么计算的?用什么软件?关键词是什么?谢谢!

先正确进行 对称破缺的单点计算,然后读取之,进行结构优化。这是一个至少2步的复合任务。绝大多数量化软件都支持UDFT计算,也支持产生对称破缺的初猜,不同软件的关键词不一样。看sob老师这篇博文了解基本知识《谈谈片段组合波函数与自旋极化单重态》http://sobereva.com/82
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发表于 Post on 2021-12-27 08:58:19 | 只看该作者 Only view this author
zjxitcc 发表于 2021-12-24 10:16
先正确进行 对称破缺的单点计算,然后读取之,进行结构优化。这是一个至少2步的复合任务。绝大多数量化软 ...

您好!我根据您的方法还有sob老师的博文做了对称破缺的初猜,用的高|斯软件,是不是输出结果显示“The wavefunction is stable under the perturbations considered.  The wavefunction is already stable.”表明对称破缺的波函数是可以的?

另外,我想尝试看看分子的共价键均裂生成两个自由基片段的过渡态,过渡态是不是属于自旋极化单重态?两个自由基片段产物由于自旋相反,是不是也是自旋极化单重态?谢谢!刚开始学习理论方面的知识,很多不懂。请多多包涵。

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发表于 Post on 2021-12-27 11:08:54 | 只看该作者 Only view this author
ABQTrap 发表于 2021-12-27 08:58
您好!我根据您的方法还有sob老师的博文做了对称破缺的初猜,用的高|斯软件,是不是输出结果显示“The wa ...

看<S**2>的值,判断是否收敛到了对称破缺单重态上。共价键均裂未必有过渡态,假设你的反应有此过渡态,那么它未必是自旋极化单重态,既取决于体系特点,也取决于泛函种类;当然,有个结论是普遍认同的:过渡态的双自由基特征或多参考态特征 强于没断键的反应物。

产物若是两个二重态的单自由基,直接优化两个单体 能量相加即可(相当于整体是三重态)。

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发表于 Post on 2022-1-20 08:38:52 | 只看该作者 Only view this author
zjxitcc 发表于 2021-12-27 11:08
看的值,判断是否收敛到了对称破缺单重态上。共价键均裂未必有过渡态,假设你的反应有此过渡态,那么它未 ...

老师您好!这段时间尝试了寻找共价键均裂的过渡态,目前只能找到三重态的过渡态,没有自旋极化单重态的过渡态。可能的确如老师所说,这个过渡态未必是自旋极化单重态。谢谢老师!

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发表于 Post on 2022-3-10 00:24:06 | 只看该作者 Only view this author
zjxitcc 发表于 2020-6-27 11:15
看你用的关键词,如果你只写了stable,那么到提示The wavefunction has an RHF -> UHF instability后面没有 ...

stable=opt之后请问自旋是多少在哪里看呢

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发表于 Post on 2022-3-10 01:07:15 | 只看该作者 Only view this author
SHANY 发表于 2022-3-9 17:24
stable=opt之后请问自旋是多少在哪里看呢

stable=opt不改变自旋多重度。参见http://sobereva.com/82
调自旋多重度是你手动改输入文件来实现的,不是靠stable=opt解决的,stable=opt只能找你给定的自旋多重度下的稳定波函数,不能改变自旋多重度本身
Zikuan Wang
山东大学光学高等研究中心 研究员
BDF(https://bdf-manual.readthedocs.io/zh_CN/latest/Introduction.html)、ORCA(https://orcaforum.kofo.mpg.de/index.php)开发团队成员
Google Scholar: https://scholar.google.com/citations?user=XW6C6eQAAAAJ
ORCID: https://orcid.org/0000-0002-4540-8734
主页:http://www.qitcs.qd.sdu.edu.cn/info/1133/1776.htm
GitHub:https://github.com/wzkchem5
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