Gaussview关于Atom List Editor里一个氢原子的问题

uenh1998 · 发表于 Post on 2022-3-14 21:29:23

本帖最后由 uenh1998 于 2022-3-14 21:32 编辑

各位老师好，最近在做蛋白配体的相关研究，利用VMD将配体分子摘出来，调整好相应的键，原子后保存成Pdb,但是打开后发现氢原子总是多一个。用Gaussview打开Pdb，并查看Atom List Editor后发现如图所示的情况。最后一行多出来了个Add。请问一下各位老师这个有什么作用。对计算和研究有没有影响，需不需要消除呢？

wangzhe · 发表于 Post on 2022-3-15 08:51:11

Add可以用来添加新的原子，不添加的话对你原来的文件没有影响

uenh1998 · 发表于 Post on 2022-3-15 09:03:27

wangzhe 发表于 2022-3-15 08:51
Add可以用来添加新的原子，不添加的话对你原来的文件没有影响

嗯明白了，十分感谢！

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[Gaussian/gview] Gaussview关于Atom List Editor里一个氢原子的问题