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[Gaussian/gview] 求助关于含OH从水中解离的过渡态搜索

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楼主
现在想做一个OH从水中解离出来然后去进攻阳离子基团,在gview中添加了水分子,并且OH和水分子间有氢键作用,结构优化是收敛的,而且结构也合理,如果想对这样的一个体系做一个过渡态的话应该怎么做呢?
我目前的做法是直接将OH从水分子中拉出来,拉到距我的阳离子的位置这样去做一个过渡态的搜索,目前过渡态是找到了,lrc跑了几个点,发现趋势也是对的
从我跑的irc曲线来看,forward方向就是成键方向,reverse方向就是OH在水分子中未解离的状态,不知道可不可以拿IRC两端的点作为我的产物和反应物,此外OH从水中解离出来可能会存在一个过渡态吗?

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发表于 Post on 2022-4-11 19:01:57 | 只看该作者 Only view this author
弱弱地问一句,你的OH是指OH-还是OH自由基?
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2022-4-11 19:18:42 | 只看该作者 Only view this author
chands 发表于 2022-4-11 19:01
弱弱地问一句,你的OH是指OH-还是OH自由基?

是OH-

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发表于 Post on 2022-4-11 19:31:27 | 只看该作者 Only view this author
按照你的意思,你似乎是想研究某个阳离子M+与水的反应:(M+) + H2O = (M+)(OH-) + (H+),还是(M+)直接与(OH-)的反应?
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2022-4-11 20:03:30 | 只看该作者 Only view this author
chands 发表于 2022-4-11 19:31
按照你的意思,你似乎是想研究某个阳离子M+与水的反应:(M+) + H2O = (M+)(OH-) + (H+),还是(M+)直接与(O ...

我是做一个-OH和阳离子的反应,但是想做成-OH从被水分子包围的环境中解离出来,然后再去进攻我的阳离子

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发表于 Post on 2022-4-11 20:16:06 | 只看该作者 Only view this author
xiaobai1 发表于 2022-4-11 20:03
我是做一个-OH和阳离子的反应,但是想做成-OH从被水分子包围的环境中解离出来,然后再去进攻我的阳离子

要用显式-隐式溶剂模型,即考虑(M+) + (OH-)(H2O)m = (M+)(OH-)(H2O)m的反应,再加上隐式溶剂模型。如果你的(M+)太小的话,要考虑(M+)(H2O)n + (OH-)(H2O)m = (M+)(OH-)(H2O)m+n的反应,再加上隐式溶剂模型。真空中(M+) + (OH-)的反应估计没有过渡态,但是在溶液中不一定,因为(OH-)和(M+)的溶解自由能很大(很负),生成电中性的(M+)(OH-)的溶解自由能可能很小。
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2022-4-11 20:58:27 | 只看该作者 Only view this author
chands 发表于 2022-4-11 20:16
要用显式-隐式溶剂模型,即考虑(M+) + (OH-)(H2O)m = (M+)(OH-)(H2O)m的反应,再加上隐式溶剂模型。如果 ...

对的,就是考虑这么个反应,我用了隐式溶剂模型,是一个-OH进攻吡啶阳离子的反应

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