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[Lammps] 求助速度自相关函数/偶极矩的时间自相关函数得到红外光谱

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各位老师,我做的是pbi和水,现在想要得到红外光谱,看文献可以利用速度自相关函数(vacf)或者偶极矩的时间自相关函数进行傅里叶变换得到,但是我现在得到的图和文献完全不一样,看了一些回答说是还需要量子校正和平滑化,不太懂什么意思,而且我怕是我的in文件写的有问题。
救救孩子吧,卡在这好几天了
(如果还需要其他文件请告诉我)
谢谢大家了!

DIPOLE.png (69.88 KB, 下载次数 Times of downloads: 31)

DIPOLE.png

VACF.png (52.65 KB, 下载次数 Times of downloads: 17)

VACF.png

文献.png (215.52 KB, 下载次数 Times of downloads: 26)

文献.png

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2#
发表于 Post on 2022-4-19 20:48:35 | 只看该作者 Only view this author
你好,请问您怎么处理偶极时间自相关函数呢?我看了一个帖子,用python处理,但是我不清楚输出的偶极公式怎么输入。

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3#
发表于 Post on 2022-5-28 17:00:55 | 只看该作者 Only view this author
你好,文献名称可以提供一下吗?我想看一下

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4#
发表于 Post on 2022-5-28 17:44:35 | 只看该作者 Only view this author
直接用lammps的vacf命令可能会使采样不足. 因为lammps只算了第一帧和后面每一帧的关联函数.

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5#
发表于 Post on 2022-7-26 22:31:09 | 只看该作者 Only view this author
请问楼主偶极矩的时间自相关函数进行傅里叶变换不准确解决了吗?找到的python脚本我也存在这个问题

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6#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2022-9-18 16:47:10 | 只看该作者 Only view this author
ZZU_SCU 发表于 2022-4-19 20:48
你好,请问您怎么处理偶极时间自相关函数呢?我看了一个帖子,用python处理,但是我不清楚输出的偶极公式怎 ...

没有处理,暂时放弃了

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7#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2022-9-18 16:47:34 | 只看该作者 Only view this author
pumpkin 发表于 2022-7-26 22:31
请问楼主偶极矩的时间自相关函数进行傅里叶变换不准确解决了吗?找到的python脚本我也存在这个问题

没有解决,不知道什么情况

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8#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2022-9-18 16:48:20 | 只看该作者 Only view this author
get-it 发表于 2022-5-28 17:44
直接用lammps的vacf命令可能会使采样不足. 因为lammps只算了第一帧和后面每一帧的关联函数.

谢谢您,但是我还是没有找到比较好的办法

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9#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2022-9-18 17:05:43 | 只看该作者 Only view this author
huyongxin 发表于 2022-5-28 17:00
你好,文献名称可以提供一下吗?我想看一下

Molecular dynamics integration and molecular vibrational theory. III. The infrared
spectrum of water

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