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[GROMACS] gmx加电场的一点疑问

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楼主
gmx在加电场时,知道不能加连续的脉冲波。但是因为实验需要,所以想出了以下的办法,请社长看看可不可行。

我想的是利用多条electric-field-x指令,来刻画场,单个指令代表一个脉冲。每条之间给出不同的时延t0,这样可以刻画添加间隔固定的连续脉冲场了。

请问社长,一个mdp里能否写多条 electric-field-x 命令呢。模拟时,这些电场命令是同时执行的吗?
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发表于 Post on 2022-5-26 03:05:56 | 只看该作者 Only view this author
只能写一条
你的情况需要写脚本,每跑一小段,自动结合另外的mdp重新产生tpr并继续跑一小段(结合之前的cpt文件),反复如此
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2022-5-26 10:48:21 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2022-5-26 03:05
只能写一条
你的情况需要写脚本,每跑一小段,自动结合另外的mdp重新产生tpr并继续跑一小段(结合之前的cp ...

谢谢社长,我试试
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