计算化学公社

 找回密码 Forget password
 注册 Register
Views: 2414|回复 Reply: 5
打印 Print 上一主题 Last thread 下一主题 Next thread

[新手求助] g09跑QST2遇到问题

[复制链接 Copy URL]

37

帖子

0

威望

135

eV
积分
172

Level 3 能力者

本帖最后由 雾雨魔理沙daze 于 2022-6-12 19:53 编辑

老师好,学生在用g09算QST2时遇到了问题。在提交任务后立刻报错,然后再打开原来的gif时就被改写了,单独看产物额外添上了一个紫色的原子不知道是什么,并且被编号为1,其余所有原子编号都被推后一位。(反应物没有任何变化,且产物仅这一个原子和编号变化其他都没变),一起看时产物呈现一堆数字而不呈现结构。原来的gif没有了,只记得命令行 # opt=(calcfc,qst2,noeigen) freq b3lyp/6-31g(d,p) scrf=(solvent=chloroform),且绝对确定原输入文件产物和反应物原子编号一一对应;报错信息如图,并贴上log文件和改后的gif。请问这一问题是为什么?该如何解决?


QST2 gif.zip

1.86 KB, 下载次数 Times of downloads: 12

QST2 log.zip

3.51 KB, 下载次数 Times of downloads: 4

1016

帖子

0

威望

2126

eV
积分
3142

Level 5 (御坂)

天上地下三山亖海五湖六合八荒九州之泛粤大典編輯委員會編外委員

2#
发表于 Post on 2022-6-12 20:20:55 | 只看该作者 Only view this author
你没写geom=connectivity,程序识别不了坐标后面那一坨成键数据导致报错。
ORCA大法好!CP2K大法好!
嶺南粤音 泛粤典 https://jyutjam.org/

山河自落蒼梧月,風雨猶驅草木兵。
san huɔɞ ki lɔk tʰɔŋ ŋ ᵑgut,fʊŋ ʝi ʝiu kʰui tʰɔu ᵐbʊk pɪŋ

37

帖子

0

威望

135

eV
积分
172

Level 3 能力者

3#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2022-6-12 20:40:57 | 只看该作者 Only view this author
chands 发表于 2022-6-12 20:20
你没写geom=connectivity,程序识别不了坐标后面那一坨成键数据导致报错。

好的 谢谢老师 我再去试下;还有个问题就是大多数情况不加geom=connectivity好像也没事 为啥这里不加就出现了问题

1016

帖子

0

威望

2126

eV
积分
3142

Level 5 (御坂)

天上地下三山亖海五湖六合八荒九州之泛粤大典編輯委員會編外委員

4#
发表于 Post on 2022-6-12 20:44:49 | 只看该作者 Only view this author
雾雨魔理沙daze 发表于 2022-6-12 20:40
好的 谢谢老师 我再去试下;还有个问题就是大多数情况不加geom=connectivity好像也没事 为啥这里不加就出 ...

你这里不加,程序就把成键数据当成第二帧的坐标。
ORCA大法好!CP2K大法好!
嶺南粤音 泛粤典 https://jyutjam.org/

山河自落蒼梧月,風雨猶驅草木兵。
san huɔɞ ki lɔk tʰɔŋ ŋ ᵑgut,fʊŋ ʝi ʝiu kʰui tʰɔu ᵐbʊk pɪŋ

37

帖子

0

威望

135

eV
积分
172

Level 3 能力者

5#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2022-6-12 20:52:28 | 只看该作者 Only view this author
chands 发表于 2022-6-12 20:44
你这里不加,程序就把成键数据当成第二帧的坐标。

明白了 谢谢您

69

帖子

0

威望

1254

eV
积分
1323

Level 4 (黑子)

6#
发表于 Post on 2022-6-13 00:26:32 | 只看该作者 Only view this author
QST2其实不如opt=TS关键词的,这种体系先做限制性优化再用opt=TS可能还比QST2更快。

本版积分规则 Credits rule

手机版 Mobile version|北京科音自然科学研究中心 Beijing Kein Research Center for Natural Sciences|京公网安备 11010502035419号|计算化学公社 — 北京科音旗下高水平计算化学交流论坛 ( 京ICP备14038949号-1 )|网站地图

GMT+8, 2026-2-24 00:29 , Processed in 0.161617 second(s), 23 queries , Gzip On.

快速回复 返回顶部 返回列表 Return to list