ORCA结构优化报错file orca_tools/qcmsg.cpp, line 465

yisui · 发表于 Post on 2022-6-20 21:29:39

各位老师，请教一下，我用orca软件做结构优化和振动分析，r2SCAN-3c opt freq 关键词，Multiwfn产生ORCA输入文件，刚一提交就出现file orca_tools/qcmsg.cpp, line 465，换其他类似结构也这样，减小nprocs，加大maxcore，依然是这样。请各位老师指点，谢谢。

sobereva · 发表于 Post on 2022-6-20 21:41:40

用B97-3c试试

wzkchem5 · 发表于 Post on 2022-6-20 22:03:33

检查openmpi安装是否正确

yisui · 发表于 Post on 2022-6-21 08:51:58

wzkchem5 发表于 2022-6-20 22:03
检查openmpi安装是否正确

检查了下，安装路径应该没问题吧。如下：
export PATH=$PATH:/home/yisui/ORCA/openmpi411/bin
export LD_LIBRARY_PATH=$LD_LIBRARY_PATH:/home/yisui/ORCA/openmpi411/lib
export PATH=$PATH:/home/yisui/ORCA/orca503
export LD_LIBRARY_PATH=$LD_LIBRARY_PATH:/home/yisui/ORCA/orca503
alias orca='/home/yisui/ORCA/orca503/orca'
which mpiexec看了下，只有：
~/ORCA/openmpi411/bin/mpiexec
mpiexec -V查看也无问题：
mpiexec (OpenRTE) 4.1.1
Report bugs to http://www.open-mpi.org/community/help/
但是，重新算了个小分子，没有任何问题。

snljty2 · 发表于 Post on 2022-6-21 09:43:32

估计是装的有问题，我这边用你的文件跑了一下，内存跟并行核数都没改，跑了十分钟没有任何问题，输出超过了你报错信息的部分。which命令肯定只能显示一个。不清楚你环境变量到底怎么设的（除了你贴出的部分），机器里还有哪些库。你用的是共享库版本么？

yisui · 发表于 Post on 2022-6-21 10:34:48

snljty2 发表于 2022-6-21 09:43
估计是装的有问题，我这边用你的文件跑了一下，内存跟并行核数都没改，跑了十分钟没有任何问题，输出超过了 ...

谢谢。下的是orca_5_0_3_linux_x86-64_shared_openmpi411，只有个openmpi库，新买的服务器只装了orca和gaussian，已初步找到原因，估计这是新装的Centos 8.5版本。我把同样的结构放在Centos 7.9下跑没有问题，看来得自己重装centos.

yisui · 发表于 Post on 2022-6-21 13:32:14

yisui 发表于 2022-6-21 10:34
谢谢。下的是orca_5_0_3_linux_x86-64_shared_openmpi411，只有个openmpi库，新买的服务器只装了orca和ga ...

问题已经找到，老机器centos7.9装了gfortran，而新机器centos8.5没有装gfortran，而且centos8.5的源已过期，一开始无法安装gfortran，更换了源，装了gfortran，更新了C和C++，重新安装OpenMPI，目前一切正常。奇怪，最开始装openmpi的时候没提醒有问题，orca做个几个小分子test一下开始没问题，就没有特别留意了

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[ORCA] ORCA结构优化报错file orca_tools/qcmsg.cpp, line 465

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