求助 关于DMOl3做吸附模拟底层结构问题

愤怒的小y

我用DMol3做了一个吸附模拟发现当底层TiO2为两层是吸附模型不能收敛而当我把TiO2底层变为三层是却收敛了这是为什么？

卡开发发

模型不符合计量比收敛就是有可能会比较困难一些，所以建议厚度按整数切。

AaronO_o

是否可能是第一个模型（2层）中z方向厚度过小，SO3与上层TiO2底部吸附，导致难以收敛？

愤怒的小y

AaronO_o 发表于 2021-10-29 09:59
是否可能是第一个模型（2层）中z方向厚度过小，SO3与上层TiO2底部吸附，导致难以收敛？

是真空层太小了吗

愤怒的小y

卡开发发 发表于 2021-10-29 09:35
模型不符合计量比收敛就是有可能会比较困难一些，所以建议厚度按整数切。

好的谢谢大神

Aridea

底层可能需要多给几层，然后固定基底。具体可以参考别人文献

愤怒的小y

卡开发发 发表于 2021-10-29 09:35
模型不符合计量比收敛就是有可能会比较困难一些，所以建议厚度按整数切。

发发大神请问什么叫按整数切是厚度0.752就就用0.8切吗

愤怒的小y

Aridea 发表于 2021-10-29 14:26
底层可能需要多给几层，然后固定基底。具体可以参考别人文献

相同的基地但是吸附不同是不是基地所需要的层数就不同是吗？是要一层一层的去试对吗？

Aridea

基底要保持一致，才能模拟bulk表面吧。多试试看几层看收敛就用几层。这方面我没做过

愤怒的小y

Aridea 发表于 2021-10-29 14:52
基底要保持一致，才能模拟bulk表面吧。多试试看几层看收敛就用几层。这方面我没做过

好的谢谢大神

AaronO_o

愤怒的小y 发表于 2021-10-29 14:09
是真空层太小了吗

我认为有可能是这样，沉积在Absorb Location那个模块里面遇到过吸附到上一层的问题。
我个人认为z轴真空层太小不能有效消除掉z方向周期性，导致SO3在两层之间有个能量极小值点，几何优化时候在这个位置附近震荡了。

一个简单的验证方法是：右键display，第二个选项卡中把z轴周期性改成2，看看那个SO3有没有吸附到上一层。就您的截图来看，我认为是吸附到上一层了。
另外真空层与其他老师所说的基底厚度等思路不互斥，都有必要谨慎的讨论。

卡开发发

愤怒的小y 发表于 2021-10-29 14:30
发发大神请问什么叫按整数切是厚度0.752就就用0.8切吗

自然数？

卡开发发

AaronO_o 发表于 2021-10-29 16:43
我认为有可能是这样，沉积在Absorb Location那个模块里面遇到过吸附到上一层的问题。
我个人认为z轴真空 ...

确实不互斥，主要lz模型的问题实在太多了，比如迄今看不懂lz要做个什么反应，会不会这个过程就不合理之类。一样样慢慢来吧。
另外，DMol3的算法计算量不大依赖真空尺寸，可以放心往上加。

愤怒的小y

卡开发发 发表于 2021-10-31 17:19
自然数？

那请问厚度按整数切是什么意思没看懂

愤怒的小y

卡开发发 发表于 2021-10-31 17:22
确实不互斥，主要lz模型的问题实在太多了，比如迄今看不懂lz要做个什么反应，会不会这个过程就不合理之类 ...

我是想做一个so2氧化成so3的过程我看有个文献里用了这个模型，想试试看行不行，因为我看文献中这种模型可以使co氧化成co2，所以我想试试so2行不行