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[GROMACS] 使用gmx_MMPBSA时,用gromacs2020如何获取nopbc的复合物轨迹

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在使用gmx_MMPBSA计算复合物的自由能时,要求输入nopbc的复合物轨迹。尝试用gromacs2018.8设置pbc=no,提示:OpenMP threads have been requested with cut-off scheme Group, but these are only supported with cut-off scheme Verlet,加上-ntmop 1,仍无法解决。之后用gromacs2020的gmx editconf 在原有结构外增加5nm的真空区,设置pbc=xyz,获取的轨迹无法被MMPBSA读取,提示:gmx trjconv failed when querying com_traj.xtc.
大家有什么好办法来准备gmx_MMPBSA所需的非周期性轨迹呢?

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