关于ReaxFF力场文件的疑惑

zhongyuabc · 发表于 Post on 2017-5-23 20:28:20

在reaxff反应力场中，涉及到很多的参数，由于要研究的体系没有现成的力场参数可用，所以我想了解力场中各个参数是什么意思，以及这些参数是如何得到的。看了reaxFFl力场的手册后，解决了部分问题，但是还是有些问题不知道，期望能得到前辈们的帮助，谢谢！
（1）在图1中的39个general parameters中，有部分数值后面标记的是not used，既然是没有用到，为什么还要写出来呢？
（2）在图2中，例如像van der Waals dissociation energy（Evdw）、Undercoordination energy（Eunder）等的数值是怎么计算出来的，是通过高斯吗？
（3）在reaxFF力场的开发中，作者会提到用量化计算一堆训练集，然后进行参数拟合就得到了反应力场中的文件，可否有相关的资料推荐，非常感谢！

sobereva · 发表于 Post on 2017-5-24 02:15:29

1 not used可能是开发者搞参数时候临时搞的一些参数，但没太大实用性，所以发布的时候就给隐藏掉了
2 你可以看看原文介绍的细节。力场的vdW参数一般都是基于实验结果和模拟结果，反复优化出来的，极少是直接通过高精度量化算的（除非那种极小体系，才是直接基于高精度算的相互作用势拟合的）。

zhongyuabc · 发表于 Post on 2017-5-24 08:51:18

sobereva 发表于 2017-5-24 02:15
1 not used可能是开发者搞参数时候临时搞的一些参数，但没太大实用性，所以发布的时候就给隐藏掉了
2 你可 ...

好的，谢谢社长

qwoop · 发表于 Post on 2017-5-24 15:10:38

可以参考ReaxFF发明者Adri C. T. van Duin的文章，例如这篇（http://pubs.acs.org/doi/abs/10.1021/acs.jpclett.6b02902）做了MoS2的力场拟合。我在用ReaxFF做一些粒子辐照方面的模拟，有空可以多交流

zhongyuabc · 发表于 Post on 2017-5-25 10:25:02

qwoop 发表于 2017-5-24 15:10
可以参考ReaxFF发明者Adri C. T. van Duin的文章，例如这篇（http://pubs.acs.org/doi/abs/10.1021/acs.jpc ...

好的，谢谢您，请问您在所做的体系，需要自己拟合参数吗？http://pubs.rsc.org/en/content/articlehtml/1994/ft/ft9949002881 这篇文献中介绍到参数拟合方法，不知您是否看懂？

get-it · 发表于 Post on 2017-5-25 15:34:36

可以看看potfit是怎么做的

zhongyuabc · 发表于 Post on 2017-5-25 15:44:23

get-it 发表于 2017-5-25 15:34
可以看看potfit是怎么做的

好的，谢谢您，我马上去看看

一颗赛艇 · 发表于 Post on 2017-6-3 01:39:06

get-it 发表于 2017-5-25 15:34
可以看看potfit是怎么做的

好像不支持ReaxFF啊

一颗赛艇 · 发表于 Post on 2017-6-3 02:07:56

本帖最后由一颗赛艇于 2017-6-3 02:09 编辑

发一下自己对力场参数的研究。时间过去太长，有一些也记得不太清楚了。

灰色的在拟合中应该是不变的，根据lammps中Reax/c模块的源码，图中红色的是被忽略的参数，其他颜色记不太清楚了……

而且，元素参数还被分成了四类，根据元素参数第四行倒数第三个和倒数第一个（是否Inner-wall），第二行第二个（是否Shielding vdWaals）

希望能够抛砖引玉

Mikasa · 发表于 Post on 2017-6-3 08:20:15

一颗赛艇发表于 2017-6-3 02:07
发一下自己对力场参数的研究。时间过去太长，有一些也记得不太清楚了。

灰色的在拟合中应该是不变的，根 ...

您好，请问您知道“switch off some bond parameters during the equilibration simulation with ReaxFF”这个是怎么实现的么？

一颗赛艇 · 发表于 Post on 2017-6-3 13:46:40

Mikasa 发表于 2017-6-3 08:20
您好，请问您知道“switch off some bond parameters during the equilibration simulation with ReaxFF ...

这个就不太清楚了。没有研究过。你上谷歌搜搜看看

Mikasa · 发表于 Post on 2017-6-3 13:53:02

一颗赛艇发表于 2017-6-3 13:46
这个就不太清楚了。没有研究过。你上谷歌搜搜看看

好的，谢谢~
还没有Google出来

get-it · 发表于 Post on 2017-6-3 22:39:35

一颗赛艇发表于 2017-6-3 01:39
好像不支持ReaxFF啊

我看的是参数拟合的方法

zhongyuabc · 发表于 Post on 2017-6-5 09:44:16

一颗赛艇发表于 2017-6-3 02:07
发一下自己对力场参数的研究。时间过去太长，有一些也记得不太清楚了。

灰色的在拟合中应该是不变的，根 ...

谢谢

xylz6188 · 发表于 Post on 2017-10-25 22:45:31

楼主，您好！我近来想做聚合物热解，但分子动力学软件只会MS里的Forcite，我看了一些文章，他们都是用Lammps里的ReadFF力场，我想着MS不是能拟合力场么，那么ReadFF力场能否直接使用？

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[综合交流] 关于ReaxFF力场文件的疑惑

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