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[新手求助] 审稿人意见求助(镧系、锕系复合物pH、pKa相关)

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对于审稿意见有些疑惑,想问一下各位老师,这篇文章研究的是镧系、锕系复合物的,审稿人问的下面几个问题,不知道怎么回答和解决,想问一下大家。谢谢!
1.The aqueous solutions are not acidic in the calculations. They are pH independent unless there is something in the solvation parameters. This was not addressed or explained.
审稿人是让算不同PH值下的溶剂化效应吗?gaussian可以算吗?

2.How were the open shell calculations done? I presume with spin unrestricted calculations. What are the values of S**2 as compared to what they should be? Does the spin stay on the Eu or Am? How much spin polarization (beta spin) is in the systems? They respond in the response but not in the text. This must be in the text.
3.The experimental gas phase basicities and experimental pKb’s are known for these compounds. How well do their calculations do for these? This was not addressed.
pKa已经在文章中计算了但是审稿人还让算这个pKb,没搞懂。

请问各位老师,我这个要用计算什么数据?
十分感谢!


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发表于 Post on 2022-6-2 22:33:08 | 只看该作者 Only view this author
高斯不能算pH,pH仅具有统计意义,在原子数少的情况下没法儿建模。比方说你算pH=7,氢离子浓度1*10^-7 mol/L,即使只放一个氢离子那得放多少个水分子进去才行。但是一些反应自由能计算可以进行pH校正。
心之所向,日复一日,必有精进

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2022-6-2 22:50:26 | 只看该作者 Only view this author
含光君 发表于 2022-6-2 22:33
高斯不能算pH,pH仅具有统计意义,在原子数少的情况下没法儿建模。比方说你算pH=7,氢离子浓度1*10^-7 mol/ ...

好的,谢谢,我想问一下,反应自由能计算进行pH校正需要用到什么公式。

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发表于 Post on 2022-6-3 04:18:32 | 只看该作者 Only view this author
836589673 发表于 2022-6-2 22:50
好的,谢谢,我想问一下,反应自由能计算进行pH校正需要用到什么公式。

看具体什么反应、pH如何影响反应物和产物的状态
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2022-6-3 10:47:30 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2022-6-3 04:18
看具体什么反应、pH如何影响反应物和产物的状态

1.是一个在硝酸溶液中萃取金属离子的反应,M(H2O)9 +L → ML(NO3)3 +9 H2O。老师我想问一下,我是不是也可以选择解释一下,这种过程很难模拟的一个原因。
2.pKa的值我根据sob老师的教程算出来了,但是pKb的值我不知道如何计算。

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发表于 Post on 2022-6-3 14:40:34 | 只看该作者 Only view this author
836589673 发表于 2022-6-3 03:47
1.是一个在硝酸溶液中萃取金属离子的反应,M(H2O)9 +L → ML(NO3)3 +9 H2O。老师我想问一下,我是不是也 ...

按pKb的定义,由pKa计算pKb。如果不知道pKb的定义,搜一下就有,这种基础知识必须背得滚瓜烂熟
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发表于 Post on 2022-6-3 14:41:49 | 只看该作者 Only view this author
836589673 发表于 2022-6-2 15:50
好的,谢谢,我想问一下,反应自由能计算进行pH校正需要用到什么公式。

先把pH换算成氢离子浓度,再用浓度校正的公式。至于如何计算不同浓度下的自由能,看物化教材
BDF(https://bdf-manual.readthedocs.io/zh_CN/latest/Introduction.html)、ORCA(https://orcaforum.kofo.mpg.de/index.php)开发团队成员

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2022-6-3 15:32:23 | 只看该作者 Only view this author
wzkchem5 发表于 2022-6-3 14:41
先把pH换算成氢离子浓度,再用浓度校正的公式。至于如何计算不同浓度下的自由能,看物化教材

好的,谢谢老师,我去查查资料。

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2022-6-3 15:33:39 | 只看该作者 Only view this author
wzkchem5 发表于 2022-6-3 14:40
按pKb的定义,由pKa计算pKb。如果不知道pKb的定义,搜一下就有,这种基础知识必须背得滚瓜烂熟

好的,谢谢老师。

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发表于 Post on 2023-11-19 16:44:45 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 Dolantin 于 2023-11-19 16:55 编辑
wzkchem5 发表于 2022-6-3 14:41
先把pH换算成氢离子浓度,再用浓度校正的公式。至于如何计算不同浓度下的自由能,看物化教材

请教下w老师,我在文献及教材里看到的pH校正计算反应自由能是这么处理的(如下图红框公式)。我如果要计算在一定的温度下不同pH时反应机理的变化,应该怎么处理呢?  pH校正反应自由能公式我看了文献,基本都是用在电化学里的HER、OER反应中,但我的反应体系是在水溶液中发生的有机小分子反应,应该怎么处理呢?  先谢谢w老师啦[url=]图片 Image[/url]



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文献中pH校正反应自由能

文献中pH校正反应自由能

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发表于 Post on 2023-11-19 17:23:54 | 只看该作者 Only view this author
Dolantin 发表于 2023-11-19 09:44
请教下w老师,我在文献及教材里看到的pH校正计算反应自由能是这么处理的(如下图红框公式)。我如果要计 ...

公式是一样的。建议自己推一遍,这样才能知道为什么pH校正的公式在电化学里和化学其他领域里是一样的
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发表于 Post on 2023-11-19 20:42:35 | 只看该作者 Only view this author
wzkchem5 发表于 2023-11-19 17:23
公式是一样的。建议自己推一遍,这样才能知道为什么pH校正的公式在电化学里和化学其他领域里是一样的

好的,谢谢w老师,我试试

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