请问有没有C语言写的MD程序

alystone · 发表于 Post on 2017-2-26 20:00:02

请问有没有C语言写的MD程序，不是C++，就是C。因为看了 the art of MD simulations这本书和代码，挺想深入学习C的MD，求教没有没。个人习惯偏好C，暂时不想再探究C++。

sobereva · 发表于 Post on 2017-2-27 03:57:36

主流的分子动力学程序用纯C的极少。一般要么Fortran要么C++
实际上用Fortran来按照那本书里写代码也完全可以，此书被一些人吐槽是Fortran风格的C语言

wbn · 发表于 Post on 2017-2-27 06:17:32

Gromacs 5.0版本之前的时候大多数内容好像都是C 编写的。之后的版本不太了解。

alystone · 发表于 Post on 2017-2-27 09:59:46

sobereva 发表于 2017-2-27 03:57
主流的分子动力学程序用纯C的极少。一般要么Fortran要么C++
实际上用Fortran来按照那本书里写代码也完全可 ...

谢谢sob老师。

alystone · 发表于 Post on 2017-2-27 10:00:01

wbn 发表于 2017-2-27 06:17
Gromacs 5.0版本之前的时候大多数内容好像都是C 编写的。之后的版本不太了解。

谢谢！

get-it · 发表于 Post on 2017-2-27 10:23:12

https://people.sc.fsu.edu/~jburkardt/c_src/md/md.html
找python MD时搜到的，只是一套很简单的MD代码

alystone · 发表于 Post on 2017-2-27 10:33:42

get-it 发表于 2017-2-27 10:23
https://people.sc.fsu.edu/~jburkardt/c_src/md/md.html
找python MD时搜到的，只是一套很简单的MD代码

非常感谢，这下能够好好研究了。还有楼上那位师兄说的很对，Gromacs5以前的版本都是C写的。5以后的一些功能改用cpp写。

qwoop · 发表于 Post on 2017-2-27 14:56:28

get-it 发表于 2017-2-27 10:23
https://people.sc.fsu.edu/~jburkardt/c_src/md/md.html
找python MD时搜到的，只是一套很简单的MD代码

请问您有Python MD的示例代码吗？

sobereva · 发表于 Post on 2017-2-27 15:26:16

qwoop 发表于 2017-2-27 14:56
请问您有Python MD的示例代码吗？

A Practical Introduction to the Simulation of Molecular Systems专门讲这些，有电子版，市面上也有影印版

get-it · 发表于 Post on 2017-2-27 15:30:58

qwoop 发表于 2017-2-27 14:56
请问您有Python MD的示例代码吗？

你看我给的链接，网页上有python版本

qwoop · 发表于 Post on 2017-2-27 16:00:13

get-it 发表于 2017-2-27 15:30
你看我给的链接，网页上有python版本

谢谢

一颗赛艇 · 发表于 Post on 2017-2-28 14:25:05

当然有。Lammps的Reaxc模块就是

QuantumicGuy · 发表于 Post on 2022-10-29 15:05:16

get-it 发表于 2017-2-27 10:23
https://people.sc.fsu.edu/~jburkardt/c_src/md/md.html
找python MD时搜到的，只是一套很简单的MD代码

我怎么打不开Fortran90的

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