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[VMD] 原子选择问题,无法进行原子选择。

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    大家好,我想请教一下,在VMD中导入pdb文件,想要对不同原子类型呈现不同的形态,但是在进行原子选择时,始终出现如下的问题,想请教一下这是那个地方除了问题呢?谢谢!

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发表于 Post on 2022-11-9 19:47:20 | 只看该作者 Only view this author
看手册,选区不是这么写的。如果元素名,比如element P。就是你那两个框的内容都得点。

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3#
发表于 Post on 2022-11-10 14:43:30 | 只看该作者 Only view this author
仔细看此文
VMD里原子选择语句的语法和例子
http://sobereva.com/504http://bbs.keinsci.com/thread-14267-1-1.html

还得注意仅当你的pdb里记录了元素信息时才能用element P,看
在VMD程序里对不同元素的原子用不同颜色显示的方法
http://sobereva.com/624http://bbs.keinsci.com/thread-26306-1-1.html
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2022-11-11 20:41:53 | 只看该作者 Only view this author
snljty2 发表于 2022-11-9 19:47
看手册,选区不是这么写的。如果元素名,比如element P。就是你那两个框的内容都得点。

好的,谢谢!

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2022-11-11 20:42:18 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2022-11-10 14:43
仔细看此文
VMD里原子选择语句的语法和例子
http://sobereva.com/504(http://bbs.keinsci.com/thread-14 ...

好的,谢谢老师。

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发表于 Post on 2022-11-16 12:01:28 | 只看该作者 Only view this author
请问你解决了吗,我也是这个问题,并且换成了name 和element也不行

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2022-11-16 17:06:28 | 只看该作者 Only view this author
chen0201 发表于 2022-11-16 12:01
请问你解决了吗,我也是这个问题,并且换成了name 和element也不行

这个选择要根据你自己的体系组成选择,你多尝试几次,我也表述不出来,想选择某一类原子,确实不好弄。

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发表于 Post on 2022-11-18 15:34:21 | 只看该作者 Only view this author
熊小熊 发表于 2022-11-16 17:06
这个选择要根据你自己的体系组成选择,你多尝试几次,我也表述不出来,想选择某一类原子,确实不好弄。

你选择的原子数多吗,就是我选择的第一类和第二类原子都有很多个,是不是这个原因呢?

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