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[新手求助] 反应物结构优化出来与产物的结构相近

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最近在算三氟化硼拉取苯基三氟化硼钾盐上的氟,生成四氟化硼和苯基二氟化硼的过程。先试着猜了下过渡态,算出来一个过渡态只有一个虚频,振动反向也是氟原子在两个硼之间震动,但跑IRC时只能跑出产物,跑不出反应物,于是想先将反应物的中间体试着优化出来,都收敛了,也没有虚频,但优化出来的结构靠近产物的结构,氟原子比较靠近三氟化硼,想问一下这种情况下是不是说明这个过程可能没有过渡态?优化出来的反应物中间体结构准确吗?

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产物

产物

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未优化的反应物中间体

未优化的反应物中间体

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发表于 Post on 2022-11-23 21:33:27 | 只看该作者 Only view this author
建模不合适。K+、PhBF3-在CH3CN溶液中是溶剂化的,不会靠这么近。我觉得可以不用加K+。另外,不排除BF3会与CH3CN形成CH3CN-BF3复合物。
ORCA大法好!CP2K大法好!
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发表于 Post on 2022-11-23 21:35:50 | 只看该作者 Only view this author
此外IRC的问题可以仿照http://sobereva.com/400解决
Zikuan Wang
山东大学光学高等研究中心 研究员
BDF(https://bdf-manual.readthedocs.io/zh_CN/latest/Introduction.html)、ORCA(https://orcaforum.kofo.mpg.de/index.php)开发团队成员
Google Scholar: https://scholar.google.com/citations?hl=zh-CN&user=XW6C6eQAAAAJ&view_op=list_works&sortby=pubdate
ORCID: https://orcid.org/0000-0002-4540-8734
主页:http://www.qitcs.qd.sdu.edu.cn/info/1034/1702.htm
本团队长期招收研究生,有意者可私信联系

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2022-11-23 22:23:09 | 只看该作者 Only view this author
chands 发表于 2022-11-23 21:33
建模不合适。K+、PhBF3-在CH3CN溶液中是溶剂化的,不会靠这么近。我觉得可以不用加K+。另外,不排除BF3会与 ...

谢谢老师的解答。我试过把钾离子放在离苯基三氟化硼负离子很远的地方,但是会报错不收敛。我还没有试过不加钾离子,我试着把钾离子去掉算一下。实验中加三氟化硼就是加的三氟化硼乙腈溶液或者三氟化硼乙醚,想问一下,如果三氟化硼和乙腈形成复合物的话应该怎么计算呢?在画结构时加入几个乙腈分子行吗?

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2022-11-23 22:30:25 | 只看该作者 Only view this author
wzkchem5 发表于 2022-11-23 21:35
此外IRC的问题可以仿照http://sobereva.com/400解决

好的,谢谢老师回答。我试着把步长增大过,从5、10、20、40、50都试过,也尝试过优化过渡态时用calcall计算,但都是一样的结果,只跑到产物,没有反应物,所以我猜想是不是过渡态找的不对的原因

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发表于 Post on 2022-11-24 07:40:23 | 只看该作者 Only view this author
memorysusu 发表于 2022-11-23 22:23
谢谢老师的解答。我试过把钾离子放在离苯基三氟化硼负离子很远的地方,但是会报错不收敛。我还没有试过不 ...

先优化CH3CN-BF3和Et2O-BF3复合物,再计算复合物与PhBF3-的反应。
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2022-11-24 09:02:57 | 只看该作者 Only view this author
chands 发表于 2022-11-24 07:40
先优化CH3CN-BF3和Et2O-BF3复合物,再计算复合物与PhBF3-的反应。

好的,谢谢老师解答,我下去先算一下

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