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[新手求助] 在计算化学反应速率时,溶剂模型的选择问题

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楼主
  在看了社长的“谈谈隐式溶剂模型下溶解自由能和体系自由能的计算”中的一文,
有一句“对于几何优化和振动分析来说SMD和IEFPCM在结果上几乎不会有什么差异对此,在对选择不同溶剂模型计算时有些困惑。
01. 在用Kisthelp 计算分子速率时能否直接用SMD模型计算?
02.在“Probing solvent effect and strong and weak interactions in 2-Nitrophenyl-hydrazine using independent gradient model and Hirshfeld from wave function calculation”一文中作者用的IEFPCM 模型进行了弱的相互作用的探究以及ESP分析。SMD模型能否也用来探究弱的相互作用的探究以及ESP分析?
谢谢大家



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发表于 Post on 2022-12-22 15:11:22 | 只看该作者 Only view this author
SMD做结构优化、频率分析容易有数值不稳定性问题,结构优化难收敛,频率计算容易有小虚频,但是如果你碰巧没碰到这些问题,那么结果仍然是可用的。所以如果你这些计算里面用SMD做结构优化、频率分析,那么有一定概率需要半途改成IEFPCM重算,除此之外没有坏处。
如果只是单点能用SMD,那么百利而无一害,几乎没有任何计算是可以用IEFPCM算单点却不能用SMD算单点的
Zikuan Wang
山东大学光学高等研究中心 研究员
BDF(https://bdf-manual.readthedocs.io/zh_CN/latest/Introduction.html)、ORCA(https://orcaforum.kofo.mpg.de/index.php)开发团队成员
Google Scholar: https://scholar.google.com/citations?user=XW6C6eQAAAAJ
ORCID: https://orcid.org/0000-0002-4540-8734
主页:http://www.qitcs.qd.sdu.edu.cn/info/1133/1776.htm
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2022-12-22 15:26:08 | 只看该作者 Only view this author
wzkchem5 发表于 2022-12-22 15:11
SMD做结构优化、频率分析容易有数值不稳定性问题,结构优化难收敛,频率计算容易有小虚频,但是如果你碰巧 ...

谢谢,算出的SMD体系中没有遇到优化难收敛和数值不稳定的情形。因为没有看到相关文献的报道用SMD模型计算,所以不太放心。

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发表于 Post on 2022-12-22 22:21:14 | 只看该作者 Only view this author
z1065480896 发表于 2022-12-22 08:26
谢谢,算出的SMD体系中没有遇到优化难收敛和数值不稳定的情形。因为没有看到相关文献的报道用SMD模型计算 ...

这个可能只是因为用户的惯性,IEFPCM提出得很早,SMD提出比较晚,如果旧方法没有明显缺陷的话,即便新方法更好,很多人也缺乏改用新方法的动力
Zikuan Wang
山东大学光学高等研究中心 研究员
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发表于 Post on 2022-12-23 01:23:50 | 只看该作者 Only view this author
SMD的surface tension parameter的优化没有针对过渡金属?对过渡金属也不一定比IEFPCM更准?

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发表于 Post on 2022-12-23 14:01:28 | 只看该作者 Only view this author
scf 发表于 2022-12-23 01:23
SMD的surface tension parameter的优化没有针对过渡金属?对过渡金属也不一定比IEFPCM更准?

SMD没有考虑过渡金属

实际研究涉及的过渡金属一般都带着配体,过渡金属被包埋程度高、原子数少,溶剂效应通常由配体贡献得明显多得多。哪怕SMD没特意考虑过渡金属,算能量的时候用SMD大概率也还是明显强于没专门考虑非极性部分的IEFPCM。
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