长的柔性烷基链优化时有没有技巧？

avatar_man · 发表于 Post on 2023-1-6 11:12:13

分子中有一个C15的柔性烷基链，结构优化时，跑了200多个循环了，总在收敛边缘徘徊而不收敛，但距离收敛限很接近，用Gview中的optimization 观察发现，基本上都是柔性链在小范围动，骨架结构基本不变化，请问这类柔性链大家优化的时候有没有技巧？谢谢。

gengle · 发表于 Post on 2023-1-6 11:41:12

我记得思想家分社的门口上有一篇文章专门讲到了收敛的问题，建议你去查一下看看。

gengle · 发表于 Post on 2023-1-6 11:45:08

http://sobereva.com/164
http://sobereva.com/61

你看是否有帮助。另外，建议再提问时能说的具体一些，如计算水平，关键词等，甚至可以贴出部分输入文件的内容。

乐平 · 发表于 Post on 2023-1-6 14:21:17

由于你提到 “骨架结构基本不变化”，所以不禁要问：长的柔性烷基链在你的体系中是关键研究对象呢？还是次要的？

如果 “C_15 长柔性烷基链” 对你的研究并不是关键结构，完全可以将其简化成乙基甚至甲基。

sobereva · 发表于 Post on 2023-1-7 08:10:09

解决方法都在http://sobereva.com/164里。
优先尝试减小步长上限结合gdiis。至于其它需要着重考虑的，贴出压缩后的输出文件别人才能告诉你

avatar_man · 发表于 Post on 2023-1-14 10:33:00

sobereva 发表于 2023-1-7 08:10
解决方法都在http://sobereva.com/164里。
优先尝试减小步长上限结合gdiis。至于其它需要着重考虑的，贴出 ...

好的，尝试解决下，谢谢

avatar_man · 发表于 Post on 2023-1-14 10:33:43

乐平发表于 2023-1-6 14:21
由于你提到 “骨架结构基本不变化”，所以不禁要问：长的柔性烷基链在你的体系中是关键研究对象呢？还是次 ...

简化不了，是个聚合过程中的单体，单体就15个碳，如果简化成短链，性质就变了，谢谢

avatar_man · 发表于 Post on 2023-1-14 10:33:52

avatar_man 发表于 2023-1-14 10:33
简化不了，是个聚合过程中的单体，单体就15个碳，如果简化成短链，性质就变了，谢谢

好的，我尝试下，谢谢

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