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[GROMACS] gromacs如何计算混合物中各组分的体积分数?

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各位老师同学们,请问gromacs能计算一个混合体系的各组分体积分数吗?或者通过质量分数可以计算吗?我以自己的理解计算和文献的数据就是对不上,也不知道是不是哪里出问题了,特来求救。下图是对应的结构化学式和信息。

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PLA和PHB重复单元的化学结构,每条链都是150个重复单元

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PLA和PHB的体积分数,没写计算过程

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发表于 Post on 2023-12-14 17:39:35 | 只看该作者 Only view this author
没有唯一的计算方法,本身凝聚相里原子的划分就不是唯一的
如果假定体积的比例在混合前后不发生变化,那么根据质量密度和分子质量就能算出来凝聚相里某种分子的体积,根据混合物里的摩尔数比例便知体积比
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2023-12-14 17:50:54 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2023-12-14 17:39
没有唯一的计算方法,本身凝聚相里原子的划分就不是唯一的
如果假定体积的比例在混合前后不发生变化,那么 ...

是的sob老师,我是通过这种方法算了下发现跟他的对不上,我猜测他是不是把各组分的轨迹文件分离出来然后计算了相应的密度,这样再乘以各组分的质量得到了相应的体积,随后得到体积分数。

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发表于 Post on 2024-4-6 18:08:07 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 Acee 于 2024-4-6 18:12 编辑
liu840397562 发表于 2023-12-14 17:50
是的sob老师,我是通过这种方法算了下发现跟他的对不上,我猜测他是不是把各组分的轨迹文件分离出来然后 ...

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