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[CP2K] 关于真空层设定的疑问

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请问大神,讲义里提到“用MT时可直接将各个方向盒子尺寸设为体系相应方向跨度的两倍,也即单侧真空层厚度可设为跨度的一半。”
下图关于真空层的设定是不是与您讲的吻合?
Z方向为非周期方向,即Z方向盒子尺寸应为68埃。
另外,加入真空层会不会对体系的密度有影响?
十分感谢!



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发表于 Post on 2023-5-10 17:06:33 | 只看该作者 Only view this author
吻合
如果你用质量除以整体盒子算密度,显然真空区越大密度越低。如果你是指slab部分的密度,只有当真空区够大时才能得到合理结果。
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2023-5-10 17:16:41 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 captain 于 2023-5-10 17:23 编辑
sobereva 发表于 2023-5-10 17:06
吻合
如果你用质量除以整体盒子算密度,显然真空区越大密度越低。如果你是指slab部分的密度,只有当真空区 ...

好的,明白了,大神!
还有一个问题请教,我用Multiwfn产生cp2k的输入文件,盒子信息如下
&CELL
      A    15.03000000     0.00000000     0.00000000
      B     0.00000000    15.04000000     0.00000000
      C     0.00000000     0.00000000    64.03400000
      PERIODIC XY #Direction(s) of applied PBC (geometry aspect)
    &END CELL
单从晶胞信息上好像看不出c方向的真空层是如上图放置的,有没有可能出现下图的情况呢?

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发表于 Post on 2023-5-10 22:02:44 | 只看该作者 Only view this author
captain 发表于 2023-5-10 17:16
好的,明白了,大神!
还有一个问题请教,我用Multiwfn产生cp2k的输入文件,盒子信息如下
&CELL

从计算角度,这个模型和1L的模型完全一样

盒子是从(0,0,0)开始的。在Multiwfn的主功能0里看一眼就知道盒子和体系的位置关系是什么样
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2023-5-10 22:04:28 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2023-5-10 22:02
从计算角度,这个模型和1L的模型完全一样

盒子是从(0,0,0)开始的。在Multiwfn的主功能0里看一眼就知道 ...

好的,明白了,谢谢大神指导!
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