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[综合交流] 求助:能垒为负值,反应速率常数如何计算

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我在计算过渡态的自由能-(反应物1+反应物2)的自由能得到的能垒为负值,于是找了反应复合物,用过渡态的自由能-反应复合物的自由能得出的能垒是正值,那计算反应速率常数时用哪一个能垒呢?

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发表于 Post on 2023-5-28 16:19:48 | 只看该作者 Only view this author
把反应复合物的生成和反应复合物的后续反应看作两步反应,按http://sobereva.com/506找决速步,算表观自由能垒
BDF(https://bdf-manual.readthedocs.io/zh_CN/latest/Introduction.html)、ORCA(https://orcaforum.kofo.mpg.de/index.php)开发团队成员

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2023-5-28 18:55:01 | 只看该作者 Only view this author
wzkchem5 发表于 2023-5-28 16:19
把反应复合物的生成和反应复合物的后续反应看作两步反应,按http://sobereva.com/506找决速步,算表观自由 ...

过渡态的自由能-(反应物1+反应物2)的自由能得到的能垒为负值,用过渡态的自由能-反应复合物的自由能得出的能垒是正值。
那按照您的说法就是应该用 过渡态的自由能 - 反应复合物 的自由能得出的能垒来计算反应速率常数对吗?那比较反应难易程度也应该用 在不同可能的反应位点它们的 过渡态的自由能 - 反应复合物 的自由能得出的能垒进行比较对吗?那使用kinthlep软件输入的反应物是单分子反应吗,只输入一个反应复合物的结构吗?

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发表于 Post on 2023-5-29 01:30:05 | 只看该作者 Only view this author
hyr95 发表于 2023-5-28 11:55
过渡态的自由能-(反应物1+反应物2)的自由能得到的能垒为负值,用过渡态的自由能-反应复合物的自由能得 ...

对。不过注意(1)要做浓度校正才能看自由能垒的正负;(2)每个反应用反应复合物还是两个反应物之和算,需要具体到每个反应来分析,不能因为某一个反应按反应复合物算,就直接认为其他反应也都要按反应复合物算。
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2023-5-29 10:16:38 | 只看该作者 Only view this author
wzkchem5 发表于 2023-5-29 01:30
对。不过注意(1)要做浓度校正才能看自由能垒的正负;(2)每个反应用反应复合物还是两个反应物之和算, ...

总的来说,就是应该找出每个位点这俩能垒中最高的那个,然后和其他位点找出的决速步能垒进行比较。

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