计算体系中在某一位置的离子在轨迹中的滞留时间可以采用什么方法？

cyx8 · 发表于 Post on 2023-11-15 16:46:21

老师您好请问“计算体系中在某一位置的离子在轨迹中的滞留时间”具体可以采用什么方法

qczgzly · 发表于 Post on 2023-11-15 17:38:20

是不是“计算体系中某一离子在轨迹中某一位置的滞留时间”？具体可以采用写VMD脚本的方法，思路就是判断每一帧离子坐标是否在指定位置区间，若在，则滞留时间=滞留时间+dt，dt是步长

sweetbotsu · 发表于 Post on 2023-11-15 19:11:12

python写个脚本呗，用MDAnalysis库

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[GROMACS] 计算体系中在某一位置的离子在轨迹中的滞留时间可以采用什么方法？