求助模拟聚合物跨膜时如何处理聚合物结构

dzdhp

     老板要求从计算的角度解释两种不同聚合物修饰的脂质体的透皮快慢。因能力有限，构建不了脂质体，只够构建两个聚合物，然后做一下跨膜模拟，这两聚合物随便拼起来的，想请教一下各位老师：怎么处理聚合物结构（已按照sob老师的帖子算好resp2电荷），因为聚合物有点长，感觉横着竖着跨膜好像都不太对劲，我是不是得人为给个外力让他两卷曲起来再模拟跨膜（已用半经验方法优化，优化完了还是长链状），或做个周期性退火模拟，取一下低温构型。烦请各位老师指教

jxin

大佬是否有解决，对于跨膜的模拟是否有好的学习方法。我模拟的体系中有聚乙二醇-6000，尝试在真空环境下做了动力学，之后蜷曲在一起，不知道这样是不是有意义。

dzdhp

jxin 发表于 2025-6-15 00:01
大佬是否有解决，对于跨膜的模拟是否有好的学习方法。我模拟的体系中有聚乙二醇-6000，尝试在真空环境下做 ...

我之后是直接给外力把蜷缩的聚合物拉过去的，但是感觉这样没有意义。强行拉聚合物会把膜结构破坏掉，大分子跨膜应该没有很好的可以参考的方式。