用Molclus调用xtb构想搜索时，在GFN0-xTB下做批量优化出错问题

yjf1997 · 发表于 Post on 2022-5-24 20:29:55

本帖最后由 yjf1997 于 2022-5-24 20:35 编辑

我照着sob老师这个链接http://bbs.keinsci.com/thread-16255-1-1.html做构象搜索时，在第二步用Molclus调用xtb在GFN0-xTB下做批量优化使用./molclus指令时出现以下问题
                     *** Configuration  2000  ***
Current date: 2022-05-24 Time: 20:21:36
Loading geometry    2000 from the inputted trajectory file
Generating xtb.xyz file...
Deleting xtbrestart
Running xtb: xtb xtb.xyz  --opt --gfn 0 --chrg 0 --uhf 0 > xtb.out
sh: xtb: command not found
Error: Cannot find .xtboptok file!
The task is failed!
Wall clock time elapsed for calculating this configuration:    0 s
Deleting charges energy wbo xtbopt.* .xtboptok xtb.out xtb.xyz xtbrestart g98*.
out tmpxx vibspectrum xtb_normalmodes hessian .tmpxtbmodef xtbhess.coord xtbtop
o.mol

然后isomers.xyz文件里也没有任何内容，请问这是什么原因，请各位老师帮忙解答一下。

wzkchem5 · 发表于 Post on 2022-5-25 03:57:51

sh: xtb: command not found
这个报错已经说得很清楚了。PATH变量没有设置或者设置错误，导致molclus找不到xtb可执行文件

yjf1997 · 发表于 Post on 2022-5-25 09:42:20

本帖最后由 yjf1997 于 2022-5-25 09:48 编辑

wzkchem5 发表于 2022-5-25 03:57
sh: xtb: command not found
这个报错已经说得很清楚了。PATH变量没有设置或者设置错误，导致molclus找不 ...

谢谢老师已经解决了，使用moluclus前先加载xtb就可以使用了

Boer · 发表于 Post on 2022-9-20 17:00:43

请问老师，我的这种情况是不是Molclus调用的问题还是xtb跑动力学没跑好的问题呀

aaq2800 · 发表于 Post on 2023-11-25 08:30:32

yjf1997 发表于 2022-5-25 09:42
谢谢老师已经解决了，使用moluclus前先加载xtb就可以使用了

请教一下，如何先加载xtb？？谢谢

sobereva · 发表于 Post on 2023-11-25 08:50:43

aaq2800 发表于 2023-11-25 08:30
请教一下，如何先加载xtb？？谢谢

一般情况下完全没有所谓的加载过程。xtb该怎么安装怎么安装，下文说了。安装（install）不能叫加载（load）

将Gaussian与Grimme的xtb程序联用搜索过渡态、产生IRC、做振动分析
http://sobereva.com/421（http://bbs.keinsci.com/thread-10106-1-1.html）

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