openmpi安装失败，显示没有fortran编译器

SpongeBob · 发表于 Post on 2021-10-22 22:11:42

我在安装openmpi-4.0.5过程中出现了一些问题。最终报错
*** Fortran compiler
checking for gfortran... gfortran
checking whether we are using the GNU Fortran compiler... no
checking whether gfortran accepts -g... no
checking whether ln -s works... yes
checking if Fortran compiler works... no

* It appears that your Fortran compiler is unable to produce working
* executables.  A simple test application failed to properly
* execute.  Note that this is likely not a problem with Open MPI,
* but a problem with the local compiler installation.  More
* information (including exactly what command was given to the
* compiler and what error resulted when the command was executed) is
* available in the config.log file in the Open MPI build directory.
**********************************************************************
configure: error: Could not run a simple Fortran program.  Aborting.

我安装了gcc9.3.0版本，输入gfortran -v后可以正常显示版本，请问可能的原因是什么？我应该怎么解决。以下是安装过程log文件，

configure.log (16.03 KB, 下载次数 Times of downloads: 0)

config.log (452.6 KB, 下载次数 Times of downloads: 2)

zjxitcc · 发表于 Post on 2021-10-22 22:22:47

运行which gfortran会显示gfortran绝对路径，类似还有which gcc, which g++，接着运行

./configure --prefix=你想安装到哪里 FC=你之前看到的gfortran绝对路径 CC=gcc绝对路径 CXX=g++绝对路径

SpongeBob · 发表于 Post on 2021-10-22 22:37:50

本帖最后由 SpongeBob 于 2021-10-22 22:40 编辑

zjxitcc 发表于 2021-10-22 22:22
运行which gfortran会显示gfortran绝对路径，类似还有which gcc, which g++，接着运行

./configure --pr ...

谢谢老师。我首先尝试which gfortran  /usr/bin/gfortran  然后输入命令./configure --prefix="/home/chem/chem/openmpi" CC=/usr/bin/gcc  FC=/usr/bin/gfortran CXX=/usr/bin/c++ 得到的报错跟之前一样。但是我将路径设置为我安装的位置。./configure --prefix="/home/chem/chem/openmpi" CC=/usr/local/gcc-9.3.0/bin/gcc  FC=/usr/local/gcc-9.3.0/bin/gfortran CXX=/usr/local/gcc-9.3.0/bin/c++
得到的错误是*** Fortran compiler
checking whether we are using the GNU Fortran compiler... yes
checking whether /usr/local/gcc-9.3.0/bin/gfortran accepts -g... yes
checking whether ln -s works... yes
checking if Fortran compiler works... no
**********************************************************************
* It appears that your Fortran compiler is unable to produce working
* executables.  A simple test application failed to properly
* execute.  Note that this is likely not a problem with Open MPI,
* but a problem with the local compiler installation.  More
* information (including exactly what command was given to the
* compiler and what error resulted when the command was executed) is
* available in the config.log file in the Open MPI build directory.
**********************************************************************
configure: error: Could not run a simple Fortran program.  Aborting.
这是因为我的gcc安装的不正确吗？

snljty · 发表于 Post on 2021-10-22 23:52:42

从一些信息猜你用的CentOS？如果是的话而且你有网和root，没必要自己编译gcc。可以用
sudo yum install centos-release-scl
sudo yum install devtoolset-9-gcc devtoolset-9-gcc-c++ devtoolset-9-gcc-gfortran
source /opt/rh/devtoolset-9/enable

SpongeBob · 发表于 Post on 2021-10-23 14:23:54

snljty 发表于 2021-10-22 23:52
从一些信息猜你用的CentOS？如果是的话而且你有网和root，没必要自己编译gcc。可以用
sudo yum install ce ...

谢谢老师，我用这种方法成功了

Mentary · 发表于 Post on 2021-11-21 18:56:18

snljty 发表于 2021-10-22 23:52
从一些信息猜你用的CentOS？如果是的话而且你有网和root，没必要自己编译gcc。可以用
sudo yum install ce ...

请问没root没网怎么办啊，折腾好久了，谢谢

zjxitcc · 发表于 Post on 2021-11-21 19:07:37

本帖最后由 zjxitcc 于 2021-11-21 19:09 编辑

Mentary 发表于 2021-11-21 18:56
请问没root没网怎么办啊，折腾好久了，谢谢

重装一个CENTOS 7.x或8.x的系统，安装时多勾几个选项就有GNU编译器了。这也就是半小时的事。记得刷机前备份重要数据。

如果不想重装系统，那你搬一下机器去连下网络安装好后再搬回来，也很快的。

snljty · 发表于 Post on 2021-11-21 20:18:09

Mentary 发表于 2021-11-21 18:56
请问没root没网怎么办啊，折腾好久了，谢谢

一个方法是做离线源。对于CentOS自带的源，直接用安装镜像mount一下就可以。对于epel这种第三方源，可以找个能联网的相同CentOS系统版本的机器（虚拟机也行），用yum install --downloadonly --downloaddir=.下载相关包，createrepo做成离线源，打个包拷贝到服务器上使用。关于如何使用和制作离线源，请自行使用搜索引擎。

Mentary · 发表于 Post on 2021-11-22 09:14:00

snljty 发表于 2021-11-21 20:18
一个方法是做离线源。对于CentOS自带的源，直接用安装镜像mount一下就可以。对于epel这种第三方源，可以 ...

好的，感谢

Mentary · 发表于 Post on 2021-11-22 09:24:09

zjxitcc 发表于 2021-11-21 19:07
重装一个CENTOS 7.x或8.x的系统，安装时多勾几个选项就有GNU编译器了。这也就是半小时的事。记得刷机前备 ...

是课题组的机器，不好弄。感谢您的回复。

鱼与茄子不可兼 · 发表于 Post on 2024-3-15 18:18:05

在超算平台个人文件夹中安装（非root），遇到同样的问题，使用以上方式均无法解决，请问各位有其他解决办法吗

abin · 发表于 Post on 2024-3-15 18:29:30

鱼与茄子不可兼发表于 2024-3-15 18:18
在超算平台个人文件夹中安装（非root），遇到同样的问题，使用以上方式均无法解决，请问各位有其他解决办法 ...

安装的时候，在所有的路径前面加上$HOME

具体看这里【以普通用户源码编译安装 gcc9 套件-哔哩哔哩】 https://b23.tv/RVMCgCy

请根据实际自己变通。

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[Linux] openmpi安装失败，显示没有fortran编译器

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