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[Material Studio] 蛭石晶胞同构置换后,用forcite模块clayff力场分配力场和电荷,不呈电中性

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原文描述:
                              
文章中化学式M1.3125(Si5.875Al2.125)(Al0.8125Mg5.1875)O20(OH)4,根据后文M为补偿阳离子,Al3+替换Si4+,Al3+替换Mg2+,推测最初的化学式为Mg3 Si4 O10 (O H)2。无法找到Tambach等人的蛭石结构cif文件。用下图中cif文件代替:

将其导入MS软件后,点自动成键,将Mg-O八面体手动相连、加氢,建立4*2超胞
[ cell form: H64 O384 Mg96 Si128 ],通过SubstitutionalDisorder脚本用13个Al替换Mg(13.54%,+13),34个Al替换Si(26.5625%,-34), 最终得到cellform为Si94Al47 Mg83 O384 H64的结构,整理为[(Si94 Al34)(Al13Mg83)O320(OH)64],即(Si5.8752 Al2.125)(Al0.8125Mg5.1875)O20(OH)4,为了平衡同构置换取代引起的负电荷,加入21个K+,用clayff力场分配力场和电荷,发现整体电荷不为0。该怎么解决?

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发表于 Post on 2023-8-30 01:37:24 | 只看该作者 Only view this author
楼主方便分享一下建好的蛭石XSD文件分享一下吗,我最近也想做蛭石的相关计算,但是Mg-O一直不成键,谢谢~

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发表于 Post on 2023-12-8 19:00:02 | 只看该作者 Only view this author
请问您解决了吗

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发表于 Post on 2023-12-12 15:32:47 | 只看该作者 Only view this author
MS里面的力场电荷是写死的,本来就不能保证电荷中性,AuToFF(https://cloud.hzwtech.com/web/pe ... /inorganic-crystals)将ClayFF力场的电荷改成了BCI计算规则,在固定阳离子电荷的前提下,可以自动调整O的电荷来保证体系的电中性,前提是用户自己上传的结构是正确的,比如Al或者Mg置换Si之后需要补充阳离子来保证电荷平衡。

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