求助：如何统计磷脂膜的曲率

不想飞的猫头鹰 · 发表于 Post on 2023-12-21 15:52:36

跑了下粗粒化复合磷脂膜在不同盐浓度下的模拟，想看看盐离子浓度对曲率的影响，搜了下没找到相关帖子或者教程...

没有编程基础，不知道gromacs有没有自带的工具可以用于说明膜整体的弯曲程度？十分感谢！

casea · 发表于 Post on 2023-12-21 18:18:29

不想飞的猫头鹰 · 发表于 Post on 2023-12-21 21:37:44

casea 发表于 2023-12-21 18:18
https://membrane-curvature.readthedocs.io/en/latest/
mdanalysis里面的一个功能

好的，谢啦，看来这样的功能只能用编程实现了，要是之后必须得说明膜曲率的话只能硬啃MDAnalysis了

rpestana94 · 发表于 Post on 2023-12-22 00:29:40

Maybe you can try with suave https://github.com/SuAVE-Software/source_v2.0, as far I know it can check for curvature in membranes

不想飞的猫头鹰 · 发表于 Post on 2023-12-22 21:46:20

rpestana94 发表于 2023-12-22 00:29
Maybe you can try with suave https://github.com/SuAVE-Software/source_v2.0, as far I know it can che ...

Thank you very much!

I will learn about this software.

不想飞的猫头鹰 · 发表于 Post on 2023-12-30 20:18:59

本帖最后由不想飞的猫头鹰于 2023-12-30 20:20 编辑

很感谢大家的帮助

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