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[辅助/分析程序] 展示一下使用ChemCrackX高度自动化核磁位移计算的工作流程与效果

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本帖最后由 Hugo_314cat 于 2025-2-10 10:48 编辑

ChemCrackX是个人在2024年2月份开始开发的一个综合性计算化学辅助工具包,旨在用尽量少的人力去做尽量多的活儿。目前CCX还在不断地开发和调试当中。

首先从ChemDraw等工具获得目标化合物的SMILES号,然后直接输入ChemCrackX就可以获得各类输入文件,这些输入文件可以直接上传至服务器中的AutoCalc平台进行自动提交计算。
待计算完之后下载各类输出文件,便可以使用ChemCrackX进行一键展示。
ChemCrackX会自动处理化合物的各个构象。


工作流程示意如下:



经过大量实测,整个工作流程中真正需要用户用手去做的事儿就是上传和下载,对经验丰富的工作者而言累计人时不会超过五分钟。

下面展示一些结果,非常的nice:



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四非院校大菜鸟

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发表于 Post on 2025-2-10 17:03:01 | 只看该作者 Only view this author
如果用户设置好了public key,可以免密码自动登录服务器的话,是不是可以把上传、下载步骤也自动化?
另外也可以考虑把整个工作流都搬到服务器上去
Zikuan Wang
山东大学光学高等研究中心 研究员
BDF(https://bdf-manual.readthedocs.io/zh_CN/latest/Introduction.html)、ORCA(https://orcaforum.kofo.mpg.de/index.php)开发团队成员
Google Scholar: https://scholar.google.com/citations?hl=zh-CN&user=XW6C6eQAAAAJ&view_op=list_works&sortby=pubdate
ORCID: https://orcid.org/0000-0002-4540-8734
主页:http://www.qitcs.qd.sdu.edu.cn/info/1034/1702.htm
本团队长期招收研究生,有意者可私信联系

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2025-2-10 17:39:06 | 只看该作者 Only view this author
wzkchem5 发表于 2025-2-10 17:03
如果用户设置好了public key,可以免密码自动登录服务器的话,是不是可以把上传、下载步骤也自动化?
另外 ...

感谢您的建议,不过我的考虑是这样的:自动化程度越高,对出错的排查和处理流程就会变得越复杂,因为有些时候编写自动化程序难以考虑到所有的错误,尤其是对有网络连接需求的内容。我希望把出错范围分别局限在我的电脑和服务器上。所以个人觉得计算归计算、处理归处理,这样容错率高一些,以及万一后续有什么改动也非常方便。
四非院校大菜鸟

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