求助Chimerax配体替换报错

zhuyoucai · 发表于 Post on 2024-1-20 12:08:42

各位老师好，目前本人在采用Chimerax中的配体替换功能，由于软件自带的配体库较少。所以我自己尝试在Chimerax自己搭配体，运行然后添加至personal library。但是每次swap liand的时候，他总是提醒我报错。
“LookupError: could not determine best path between 1 N -1.163865 -1.293959 -0.124850 and 2 N 1.261765 0.074861 0.156870

File "C:\Users\49347\AppData\Local\UCSF\ChimeraX\1.7\Python311\site-packages\AaronTools\geometry.py", line 2083, in shortest_path
raise LookupError(

See log for complete Python traceback.”

不知道各位老师有没有遇到过这种情况，非常感谢！

zhuyoucai · 发表于 Post on 2024-1-20 12:10:30

我还尝试自己使用配体金属化合物在高斯优化完后，添加至SEQCROW个人库，也报错。

sobereva · 发表于 Post on 2024-1-20 22:57:42

直接用gview多省事，没看出有什么必要用ChimeraX

zhuyoucai · 发表于 Post on 2024-1-21 10:54:19

sobereva 发表于 2024-1-20 22:57
直接用gview多省事，没看出有什么必要用ChimeraX

老师，就是我一条路径有十几个结构，这个可以批量替换配体。

		自动登录 Automatic login	找回密码 Forget password
密码 Password			注册 Register

[建模与可视化] 求助Chimerax配体替换报错