计算化学公社

 找回密码 Forget password
 注册 Register
Views: 970|回复 Reply: 12
打印 Print 上一主题 Last thread 下一主题 Next thread

[Gaussian/gview] 求助gaussian 16中计算分子内能量转移EET的速率的方法

[复制链接 Copy URL]

12

帖子

0

威望

257

eV
积分
269

Level 3 能力者

请问各位大神,我看到一篇论文里面的能量转移可以用Marcus理论公式去计算,公式里面的V就是在G16里面计算出来的耦合值,查看g16手册里面关于能量转移EET的部分,有提到V的计算,最后输出了total couping被用来计算EET的速率,但疑惑的是,关于其他的参数(△G,重组能λ)该如何表征出来呢?谢谢大家啦!!!

20230627194605.png (162.19 KB, 下载次数 Times of downloads: 18)

DOI:10.1002/ange.202113425的支持信息

DOI:10.1002/ange.202113425的支持信息

图片1.png (241.37 KB, 下载次数 Times of downloads: 16)

G16里面的EET内容部分

G16里面的EET内容部分

S-Organic Supramolecular Zippers with Ultralong Organic.pdf

3.61 MB, 下载次数 Times of downloads: 37

5万

帖子

99

威望

5万

eV
积分
112384

管理员

公社社长

2#
发表于 Post on 2023-6-27 20:08:07 | 只看该作者 Only view this author
不要自己在标题里手写【Gaussian/gview】这种标签。这次给你改了,以后注意
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入“北京科音”微信公众号获取北京科音培训的最新消息、避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气非常高、专业性特别强的综合性理论与计算化学交流QQ群“思想家公社QQ群”:1号:18616395,2号:466017436,3号:764390338,搜索群号能搜到哪个说明目前哪个能加,合计9000人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大的量子化学波函数分析程序)
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu
Money and papers are rubbish, get a real life!

1万

帖子

0

威望

7398

eV
积分
18160

Level 6 (一方通行)

3#
发表于 Post on 2023-6-27 20:30:33 | 只看该作者 Only view this author
BDF(https://bdf-manual.readthedocs.io/zh_CN/latest/Introduction.html)、ORCA(https://orcaforum.kofo.mpg.de/index.php)开发团队成员

12

帖子

0

威望

257

eV
积分
269

Level 3 能力者

4#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2023-6-27 20:56:25 | 只看该作者 Only view this author
wzkchem5 发表于 2023-6-27 20:30
参见https://en.wikipedia.org/wiki/Marcus_theory和http://sobereva.com/330

谢谢老师,请问想要表征的是两不同分子间的能量转移,http://sobereva.com/330中的分子态与态的之间的耦合,是否同样适用呢?

12

帖子

0

威望

257

eV
积分
269

Level 3 能力者

5#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2023-6-27 20:56:54 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2023-6-27 20:08
不要自己在标题里手写【Gaussian/gview】这种标签。这次给你改了,以后注意

好哒sob老师,我记住了,感谢~

1万

帖子

0

威望

7398

eV
积分
18160

Level 6 (一方通行)

6#
发表于 Post on 2023-6-27 21:30:45 | 只看该作者 Only view this author
pengliyuan 发表于 2023-6-27 13:56
谢谢老师,请问想要表征的是两不同分子间的能量转移,http://sobereva.com/330中的分子态与态的之间的耦 ...

一样的,Marcus理论对于电子转移、能量转移,乃至ISC,都是一样的公式,只不过转移矩阵元以及计算所需的各个单点能、自由能注意不要套错了
BDF(https://bdf-manual.readthedocs.io/zh_CN/latest/Introduction.html)、ORCA(https://orcaforum.kofo.mpg.de/index.php)开发团队成员

12

帖子

0

威望

257

eV
积分
269

Level 3 能力者

7#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2023-6-28 10:50:48 | 只看该作者 Only view this author
wzkchem5 发表于 2023-6-27 21:30
一样的,Marcus理论对于电子转移、能量转移,乃至ISC,都是一样的公式,只不过转移矩阵元以及计算所需的 ...

谢谢老师,这个单点能 可以根据A分子的S1的势能面与B分子S1的势能面,利用四点法求出重组能,以及这个V可以利用G16输出,但这自由能G我如何获取,与电子转移过程的自由能G有何区别呀?,谢谢!!

1万

帖子

0

威望

7398

eV
积分
18160

Level 6 (一方通行)

8#
发表于 Post on 2023-6-28 16:19:14 | 只看该作者 Only view this author
pengliyuan 发表于 2023-6-28 03:50
谢谢老师,这个单点能 可以根据A分子的S1的势能面与B分子S1的势能面,利用四点法求出重组能,以及这个V可 ...

取为反应的Gibbs自由能变。你只要知道这个电子转移/能量转移/ISC过程的反应物和产物,用产物的自由能之和减去反应物的自由能之和就行了
BDF(https://bdf-manual.readthedocs.io/zh_CN/latest/Introduction.html)、ORCA(https://orcaforum.kofo.mpg.de/index.php)开发团队成员

12

帖子

0

威望

257

eV
积分
269

Level 3 能力者

9#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2023-6-30 14:11:00 | 只看该作者 Only view this author
wzkchem5 发表于 2023-6-28 16:19
取为反应的Gibbs自由能变。你只要知道这个电子转移/能量转移/ISC过程的反应物和产物,用产物的自由能之和 ...

感谢老师~~

74

帖子

0

威望

1388

eV
积分
1462

Level 4 (黑子)

小趴菜

10#
发表于 Post on 2023-7-8 16:20:37 | 只看该作者 Only view this author
文献可以分享一下嘛

64

帖子

0

威望

213

eV
积分
277

Level 3 能力者

11#
发表于 Post on 2024-2-1 12:51:18 | 只看该作者 Only view this author
wzkchem5 发表于 2023-6-27 21:30
一样的,Marcus理论对于电子转移、能量转移,乃至ISC,都是一样的公式,只不过转移矩阵元以及计算所需的 ...

老师您好!我还是有一些不理解,想向您请教。T*+3O2→S0+1O2的能量转移过程,重组能是仅计算T*→S0之间的吗?是否需要加上3O2→1O2之间的重组能呢?

1万

帖子

0

威望

7398

eV
积分
18160

Level 6 (一方通行)

12#
发表于 Post on 2024-2-1 18:21:23 | 只看该作者 Only view this author
15689900879@163 发表于 2024-2-1 05:51
老师您好!我还是有一些不理解,想向您请教。T*+3O2→S0+1O2的能量转移过程,重组能是仅计算T*→S0之间的 ...

需要。可以这么想:3O2和T*都是反应物,两者的地位是完全平等的,没有任何道理只计算其中一个的重组能而不计算另一个
BDF(https://bdf-manual.readthedocs.io/zh_CN/latest/Introduction.html)、ORCA(https://orcaforum.kofo.mpg.de/index.php)开发团队成员

64

帖子

0

威望

213

eV
积分
277

Level 3 能力者

13#
发表于 Post on 2024-2-2 22:21:33 | 只看该作者 Only view this author
wzkchem5 发表于 2024-2-1 18:21
需要。可以这么想:3O2和T*都是反应物,两者的地位是完全平等的,没有任何道理只计算其中一个的重组能而 ...

明白了,谢谢老师!

本版积分规则 Credits rule

手机版 Mobile version|北京科音自然科学研究中心 Beijing Kein Research Center for Natural Sciences|京公网安备 11010502035419号|计算化学公社 — 北京科音旗下高水平计算化学交流论坛 ( 京ICP备14038949号-1 )|网站地图

GMT+8, 2024-11-25 13:47 , Processed in 0.184924 second(s), 23 queries , Gzip On.

快速回复 返回顶部 返回列表 Return to list