amber的xleap出现have no a type

yxp · 发表于 Post on 2024-2-3 19:26:22

amber的leap时saveAmberParm DOPC DOPC_128.prmtop DOPC_128.inpcrd 输入后就出现图内的问题到底怎么解决，有没有大老帮帮我

Serious · 发表于 Post on 2024-2-4 13:13:16

1）把体系、输入等信息说清楚。。
2）报错是没有source相关力场文件，比如leaprc.water.tip3p。。

yxp · 发表于 Post on 2024-2-5 14:13:30

Serious 发表于 2024-2-4 13:13
1）把体系、输入等信息说清楚。。
2）报错是没有source相关力场文件，比如leaprc.water.tip3p。。

感谢，我source的是source leaprc.lipid21
> source leaprc.ff14SB
> loadamberparams frcmod.ionsjc_tip3p
这三个力场文件，请问有问题吗

yxp · 发表于 Post on 2024-2-5 14:26:59

source leaprc.protein.ff19SB
source leaprc.gaff2
source leaprc.water.opc
loadamberparams PNS.frcmod2
loadamberparams PNS.frcmod1
loadoff PNS.lib
mol = loadpdb 5kp7_clean_fix_modify.pdb
solvateoct mol OPCBOX 8.0
addionsrand mol Na+ 0
saveamberparm mol 5kp7-bcc.prmtop 5kp7-bcc.inpcrd

这段在tleap中也有类似错误，求助各位同志

		自动登录 Automatic login	找回密码 Forget password
密码 Password			注册 Register

[Amber] amber的xleap出现have no a type