已经安装了高版本的GCC和gfortran，但是OpenMPI安装仍显示找不到fortran编译器

j5888xm

如图所示，运行gcc -v和gfortran -v时都可以正常显示版本，但是在运行./configure --prefix=/usr/local/openmpi --disable-builtin-atomics时会报如下的错误


指定gcc和gfortran路径以后，运行./configure --prefix=/usr/local/openmpi FC=/usr/local/gcc-13.2.0/bin/gfortran CC=/usr/local/gcc-13.2.0/bin/gcc CXX=/usr/local/gcc-13.2.0/bin/g++仍会报相同的错误

我们的服务器集群有root权限，但是不能联网

屡次尝试均未成功，因此求助各位老师，十分感激

zjxitcc

/usr/local/gcc-13.2.0/bin/gfortran这个路径和相应的可执行文件是真实存在的么？

另外，你编译gcc的时候好像没看到有加--enable-languages=c,c++,fortran，可以参考此文《Linux下安装高版本GCC》

pwzhou

根据个人经验，这个应该是gfortran编译软件的时候无法正常生成可执行性文件造成的，一般是因为用户在编译目录下没有权限导致的，这种情况可能是用户用了root用户解压文件，但是用普通用户去执行编译，如果一直是用root用户编译，那就应该不是这个原因。还有一个可能的原因就是编译所在目录所在的分区写满了，再一个可能的原因，编译目录是NFS共享出来的，NFS没配置好导致在其他节点无法写文件。

j5888xm

zjxitcc 发表于 2023-12-1 12:38
/usr/local/gcc-13.2.0/bin/gfortran这个路径和相应的可执行文件是真实存在的么？

另外，你编译gcc的时 ...

谢谢老师，我检查了一下，第一个可执行文件真实存在，但是第二个编译gcc的时候没有加fortran，已经解决了，再次表达感谢！

j5888xm

pwzhou 发表于 2023-12-1 14:14
根据个人经验，这个应该是gfortran编译软件的时候无法正常生成可执行性文件造成的，一般是因为用户在编译目 ...

好的好的，谢谢老师

Cara

zjxitcc 发表于 2023-12-1 12:38
/usr/local/gcc-13.2.0/bin/gfortran这个路径和相应的可执行文件是真实存在的么？

另外，你编译gcc的时 ...

老师你好，我想请教一下问题，我第一次在linux系统安装软件，由于原来的gcc版本太低，于是按照http://bbs.keinsci.com/thread-33603-1-1.html安装并激活了gcc9.3.0版本，但是在安装CP2K依赖库的时候报错C++ compiler cannot create executables，查看gcc版本发现好像仍是旧版。请问这种情况可以如何解决？

zjxitcc

Cara 发表于 2024-3-8 19:45
老师你好，我想请教一下问题，我第一次在linux系统安装软件，由于原来的gcc版本太低，于是按照http://bbs ...

先运行
which gcc
which g++
which gfortran
展示一下编译器版本，否则不能相信你安装并激活了gcc9.3.0。如果确实有，那么可以尝试运行
export CC=上面那个gcc路径
export CXX=上面那个g++路径
export F90=上面那个gfortran路径
export F77=上面那个gfortran路径
然后从零开始编译CP2K。如果整了很久也不行，建议放弃/不安装高版本GCC，采用Intel编译《离线安装CP2K-2022.2_Intel编译器版》

Cara

zjxitcc 发表于 2024-3-8 19:50
先运行
which gcc
which g++

老师，运行完之后好像无法看出编译器的版本，gcc --version可以看出是9.3.0，但是rpm -qa  grep gcc是4.8.5。不知道这种情况是哪里的错误。老师我还有一个疑问，root账户用Inter编译的话，是否会影响目前集群里用低版本CP2K的同学作业正常运行？