分子中指定原子带电荷

0916 · 发表于 Post on 2018-1-29 22:58:49

麻烦请教下，gaussian如何指定分子中的某一个原子带上电荷？gaussian中每个原子仅仅以坐标的形式给出，在输入文件第给出分子总的电荷数。如果对于一个咪唑离子液体，初始态的正电荷要求分布在N上，但是输入文件没有体现出来N是以离子形式存在。

zjxitcc · 发表于 Post on 2018-1-29 23:22:02

量子化学计算不需要指定电荷在哪个原子上，只需指定整个分子的带电量即可，算出来电荷自然会在你想要的那个原子上。如果不是的话，不是量化计算错了，而是我们的直觉错了。咪唑离子液体的正电荷也并不是全在N原子上的，那只是一种传统的形象化表示而已。并不是+号写在哪里，哪个原子就带啥电荷。

0916 · 发表于 Post on 2018-1-30 00:29:45

zjxitcc 发表于 2018-1-29 23:22
量子化学计算不需要指定电荷在哪个原子上，只需指定整个分子的带电量即可，算出来电荷自然会在你想要的那个 ...

谢谢啦！

让你变成回忆 · 发表于 Post on 2018-1-30 09:12:10

譬如DFT计算，就是一个电子密度自洽迭代的过程，所以就算你初始指定了某个原子或者某个基团上带有多少电荷，最终自洽迭代完成以后，一定是电子密度在整个分子水平达到收敛。所以在量化中，指定某个原子或者基团的电荷没有任何意义。

chiweijie · 发表于 Post on 2018-1-30 09:26:29

可以用NWCHEM实现

sobereva · 发表于 Post on 2018-1-30 12:31:16

此文最后一节专门说了这事
谈谈片段组合波函数与自旋极化单重态
http://sobereva.com/82

非要这么做，看此文，但是要搞清楚物理意义
谈谈约束性DFT (CDFT)
http://sobereva.com/271

0916 · 发表于 Post on 2018-1-30 23:01:27

让你变成回忆发表于 2018-1-30 09:12
譬如DFT计算，就是一个电子密度自洽迭代的过程，所以就算你初始指定了某个原子或者某个基团上带有多少电荷 ...

嗯嗯，谢谢啦。

0916 · 发表于 Post on 2018-1-30 23:04:54

sobereva 发表于 2018-1-30 12:31
此文最后一节专门说了这事
谈谈片段组合波函数与自旋极化单重态
http://sobereva.com/82

谢谢sobereva老师。

第十九路猪猴 · 发表于 Post on 2018-2-3 20:28:51

受益匪浅

星海湾阿杜 · 发表于 Post on 2024-3-25 18:27:38

正好我也在算一个两性离子的分子，这篇很有用

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[新手求助] 分子中指定原子带电荷