MS中的dmol3优化结构问题

小草莓

用MS中的dmol3优化结构，大约82个原子，但是优化完显示错误，这是什么原因输出文件
Message: DMol3 job failed
Error: DMol3 exiting
Message: License checkin of MS_dmol successful
Message: License checkin of MS_dsolid successful
Error: Overlap matrix is not positive definite.
This most likely means the basis set contains linear dependencies.
Consider increasing the atomic cutoff parameter or changing the basis set.
输入文件
# Task parameters
Calculate                     optimize
Opt_energy_convergence        1.0000e-006
Opt_gradient_convergence      4.0000e-003 A
Opt_displacement_convergence  5.0000e-003 A
Opt_iterations                500
Opt_max_displacement          0.3000 A
Symmetry                      on
Max_memory                    2048
File_usage                    smart
Scf_density_convergence       1.000000e-006
Scf_charge_mixing             2.000000e-001
Scf_spin_mixing               5.000000e-001
Scf_diis                      6 pulay
Scf_iterations                500

# Electronic parameters
Spin_polarization             unrestricted
Charge                        0
Basis                         dnp
Pseudopotential               dspp
Functional                    pbe
Aux_density                   hexadecapole
Dftd                          G06
DFTD_params                   custom 0.7500 20.0000

Integration_grid              fine
Occupation                    thermal 0.0050
Cutoff_Global                 4.7000 angstrom
Cosmo                         ibs
COSMO_Dielectric              78.5400     Water

# Kpoint definition file (intervals/offset):
Kpoints                       file     3 3 1 0.0000 0.0000 0.0000
B2.kpoints

# Calculated properties
Mulliken_analysis             charge
Hirshfeld_analysis            charge

小可就要学习

是不是原子太多了，我每次优化结构，稍复杂一点就容易出错

mint-xxx

请问你的问题解决了吗？我也遇到了一样的问题，我的原子接近80个，出现这样的问题，是不是该构型就是无法优化成功

卡开发发

mint-xxx 发表于 2024-3-30 16:08
请问你的问题解决了吗？我也遇到了一样的问题，我的原子接近80个，出现这样的问题，是不是该构型就是无法优 ...

首先先排查截断半径是否不够大，其次再看积分网格是否充分，这两者没问题实在不行只好换基组版本。

mint-xxx

好的，谢谢你！我去试试