关于模拟动力学过后键特别长的问题

zxc · 发表于 Post on 2022-11-6 14:21:51

各位老师能不能帮我解答一下，在进行动力学过后，就发现键被拉得很长很长，不知道是什么原因，力场选择的是compass，做的NVT，
谢谢

chands · 发表于 Post on 2022-11-6 20:29:50

没用过M$。但是分子力学/动力学出现这种情况有可能是某几个原子的距离太小了，或者盒子边上的原子与PBC的镜面里的原子的距离太小了，斥力太大，导致分子跑散了。

人生若只如初见 · 发表于 Post on 2024-8-28 20:05:12

我也遇到了这个问题，请问怎么解决的呢

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