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[GROMACS] GROMACS做适体界面模拟体系时在能量最小化步骤遇到结构崩溃问题该如何解决？

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发表于 Post on 2024-5-30 18:09:27 | 只看该作者 Only view this author |只看大图 View big picture 回帖奖励 |倒序浏览 Reverse view |阅读模式 Reading model
  各位老师好！
  模型为DNA适体接上巯基己醇小分子再搭建到金表面上（如图1所示，对应total.pdb文件）。能量最小化后结构崩溃了（如图2所示，对应total-minim.pdb文件），请问如何解决此问题？附件是输入文件压缩包。望老师们解答，十分感谢！  


输入文件.zip

249.16 KB, 下载次数 Times of downloads: 3
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