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[Gaussian/gview] 亚砜中硫原子的手性在gview中怎么构建

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本帖最后由 751960653 于 2024-7-1 17:25 编辑

亚砜基团,比如下图这个结构,有一对孤立的电子,硫原子是手性的,这在gview中应该怎么构建出来?
此外输入文件中的电荷和自旋多重度应该分别是多少?


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发表于 Post on 2024-7-1 17:34:00 | 只看该作者 Only view this author
通过调节C-C-S-O二面角
不要问具体体系的电荷和自旋多重度,否则换一个体系你还是不会判断。电荷由形式电荷之和确定,自旋多重度由主要共振式的单电子数以及Hund规则确定。

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Zikuan Wang
山东大学光学高等研究中心 研究员
BDF(https://bdf-manual.readthedocs.io/zh_CN/latest/Introduction.html)、ORCA(https://orcaforum.kofo.mpg.de/index.php)开发团队成员
Google Scholar: https://scholar.google.com/citations?user=XW6C6eQAAAAJ
ORCID: https://orcid.org/0000-0002-4540-8734
主页:http://www.qitcs.qd.sdu.edu.cn/info/1133/1776.htm
GitHub:https://github.com/wzkchem5
本团队长期招收研究生,有意者可私信联系

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2024-7-1 18:37:20 | 只看该作者 Only view this author
wzkchem5 发表于 2024-7-1 17:34
通过调节C-C-S-O二面角
不要问具体体系的电荷和自旋多重度,否则换一个体系你还是不会判断。电荷由形式电 ...

谢谢,调二面角可以,镜像翻转也可以。

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发表于 Post on 2024-7-1 19:51:31 | 只看该作者 Only view this author
我是这么做的:
1. 构建 S 的化合物

2.将烷基和 O 原子加上


3.将 S-O 键的键长改成和 S=O 的键长的距离


4. 利用 GaussView 6 的镜像功能,翻转


5. 去掉 Cl 以及多余的 H ,然后将 S-H 键改成和原始 S-H 一样的键长就行了

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发表于 Post on 2024-7-3 08:44:07 | 只看该作者 Only view this author
楼上是不是有点过于复杂了?R基团面板里不是自带的有吗?两秒完成的事

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2024-7-3 16:04:50 | 只看该作者 Only view this author
sai77 发表于 2024-7-3 08:44
楼上是不是有点过于复杂了?R基团面板里不是自带的有吗?两秒完成的事

4楼的方法是将l硫作为手性中心,分别构建S和R型。

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