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[CP2K] 求助:如何使用CP2K进行半经验优化

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最近入门CP2K,想使用CP2K中的GUN-xtb,AM1,PM3半经验优化方法,请问一下参数应该如何设置呢?

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喵星人

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发表于 Post on 2020-8-7 11:52:19 | 只看该作者 Only view this author
AM1,PM3支持的程序多得很,不知道为为什么要用CP2K。独立的xTB程序反正做不了AM1和PM3
做半经验优化,要用GFN-xTB方法,用xTB程序本身就可以,也可以和Gaussian联用,见http://bbs.keinsci.com/thread-10106-1-1.html
要用其他半经验SCF方法,比较新的PM6各种修改版和PM7,Gaussian就支持,也可以MOPAC,AM1和PM3精度很差劲,没有什么卵用。
你这个帖子怎么会发到资源分享的

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3#
发表于 Post on 2020-8-7 22:16:59 | 只看该作者 Only view this author
除非有别的理由 不然无脑xtb就行 感觉xtb大部分情况不输PM7 有的地方更好

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发表于 Post on 2020-8-8 06:53:21 | 只看该作者 Only view this author
看清楚板块再发贴,CP2K求助帖干嘛发到量子化学版的资源分享子板块?以后发帖不看清楚板块将扣分甚至禁言处理。已经把你的帖子移动了。
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入北京科音微信公众号获取北京科音培训的最新消息,并避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气极高、专业性特别强的理论与计算化学综合交流群思想家公社QQ群(群号见此链接),合计达一万多人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
Google Scholar:https://scholar.google.com/citations?user=tiKE0qkAAAAJ
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2020-8-8 09:35:09 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2020-8-8 06:53
看清楚板块再发贴,CP2K求助帖干嘛发到量子化学版的资源分享子板块?以后发帖不看清楚板块将扣分甚至禁言处 ...

抱歉第一次发帖,没有经验,下一次一定注意,谢谢sob老师

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发表于 Post on 2020-10-9 22:50:49 | 只看该作者 Only view this author
贴一个官方给的PM6的简单例子,供参考
  1. &GLOBAL
  2.   PROJECT ZrF2-PM6
  3.   RUN_TYPE ENERGY_FORCE
  4.   PRINT_LEVEL LOW
  5. &END GLOBAL
  6. &FORCE_EVAL
  7.   METHOD Quickstep
  8.   &DFT
  9.     ROKS
  10.     MULTIP 3
  11.     &QS
  12.       METHOD PM6
  13.       &SE
  14.       &END
  15.     &END QS
  16.     &SCF
  17.       MAX_SCF 10
  18.       EPS_SCF 1.0E-6
  19.       SCF_GUESS mopac
  20.       &MIXING
  21.           METHOD DIRECT_P_MIXING
  22.           ALPHA   0.1
  23.       &END
  24.       &OT
  25.         ROTATION
  26.         LINESEARCH 3PNT
  27.         MINIMIZER CG
  28.         PRECONDITIONER NONE
  29.       &END
  30.       &OUTER_SCF
  31.         EPS_SCF 1.0E-6
  32.         MAX_SCF 2
  33.       &END
  34.     &END SCF
  35.   &END DFT
  36.   &SUBSYS
  37.     &CELL
  38.       ABC 10.0 10.0 10.0
  39.       PERIODIC NONE
  40.     &END CELL
  41.     &COORD
  42. F     0.000000     0.000000     0.000000
  43. Zr     0.000000     0.000000     1.935824
  44. F     1.757762     0.000000     2.746804
  45.     &END COORD
  46.     &PRINT
  47.       &KINDS
  48.         BASIS_SET
  49.         POTENTIAL
  50.       &END KINDS
  51.     &END PRINT
  52.   &END SUBSYS
  53. &END FORCE_EVAL
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发表于 Post on 2021-2-10 03:46:26 | 只看该作者 Only view this author
如果你是要算孤立体系,完全没必要用CP2K
如果是算周期性体系,CP2K里半经验用着非常难受。用CP2K支持的GFN1-xTB强得多,而且普适性和可靠性都比PM7更好,就更别提和完全过时的AM1和PM3比了
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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发表于 Post on 2023-8-9 11:17:01 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2021-2-10 03:46
如果你是要算孤立体系,完全没必要用CP2K
如果是算周期性体系,CP2K里半经验用着非常难受。用CP2K支持的GF ...

老师你好,请问一下有没有免费的算孤立体系的分子动力学软件推荐呢?

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发表于 Post on 2023-8-9 22:21:57 | 只看该作者 Only view this author
天月风见 发表于 2023-8-9 11:17
老师你好,请问一下有没有免费的算孤立体系的分子动力学软件推荐呢?
如果是AIMD层面,看
使用ORCA做从头算动力学(AIMD)的简单例子
http://sobereva.com/576http://bbs.keinsci.com/thread-20800-1-1.html
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发表于 Post on 2024-7-5 20:06:03 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2021-2-10 03:46
如果你是要算孤立体系,完全没必要用CP2K
如果是算周期性体系,CP2K里半经验用着非常难受。用CP2K支持的GF ...

老师您好,请问周期性体系用什么半经验方法比较好呢

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发表于 Post on 2024-7-7 15:45:47 | 只看该作者 Only view this author
lleemmoonn 发表于 2024-7-5 20:06
老师您好,请问周期性体系用什么半经验方法比较好呢

前面说了,GFN1-xTB。但普适性、稳健性和精度,与DFT仍有很大差距
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