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[配置讨论] 实验室分子动力学模拟服务器配置咨询

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大家好!
实验室想组装一台用于分子动力学模拟的服务器,预算在四五万的样子。下面是Sob老师的推荐(http://sobereva.com/444),想请教下还可以在哪些方面再提高下吗?谢谢!

极高性能分子动力学服务器推荐配置
CPU:AMD Ryzen 9 7950X(16核,4.5-5.7G,集显)
主板:技嘉B650M AORUS ELITE AX 小雕
CPU、主板套装价约4250
散热器:瓦尔基里GL360水冷 630元
硬盘:希捷 银河企业级 8TB 256MB 7200rpm SATA3 (ST8000NM017B)  1330
显卡:微星4090D-魔龙SLIM-24G  15000(预算不够的话用微星万图师RTX 4080 SUPER 16G VENTUS 3X OC,9000)
内存:2*金士顿FURY 32GB DDR5-5200  2*650
电源:海韵FOCUS GX-1000 ATX3 1300
机箱:先马黑洞X  390
键盘鼠标:罗技MK200 多媒体套装  80
总价:约24300

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发表于 Post on 2024-11-11 18:50:50 | 只看该作者 Only view this author
把数量再提高点,买两台
又菜又爱玩

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发表于 Post on 2024-11-11 20:17:31 | 只看该作者 Only view this author
CPU:9950x和7950x价格差距1000以内就上9950x

内存可以升级到DDR5 6000的32G*2,价钱和5200几乎一样。

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发表于 Post on 2024-11-12 13:00:46 | 只看该作者 Only view this author
买两台是最佳选择。单机没有进一步可提升的余地

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chengecg + 3 谢谢

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北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大的量子化学波函数分析程序)
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu
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发表于 Post on 2024-11-12 13:11:29 | 只看该作者 Only view this author
我这边测试,
NAMD.GPU, 在固态硬盘,跑得更快。

两台的话,每台机器,
SATA 固态做系统盘,240GB即可;
一块NVMe固态, 计算读写。

两台机器,配置一个机械硬盘, 做数据。

千兆或者万兆连起来, slurm控制GPU调度以及计算读写,计算读写采用本地NVMe固态硬盘,
算完毕后, 数据自动拷贝到数据目录。

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chengecg + 1 谢谢

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2024-11-13 15:16:29 | 只看该作者 Only view this author
好的,谢谢各位老师的信息!

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