利用柔性扫描计算受阻转子时，相对能量计算为负值的疑问

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    本人尝试利用MESS软件计算反应速率，基于柔性扫描方法来考虑过渡态中的受阻转子，得到的结果如下图：

    在扫描过程中相对能量会变为负值（将过渡态的能量作为零点）。但我在看完4-5篇文献附件所计算的受阻转子后发现他们计算的能量全为正，即便类似的体系也是这样，所以想请教各位大佬：
       1.我所计算的结果是否正确；
       2.在写MESS输入文件时是应该将过渡态能量作为零点还是应该将扫描曲线中能量最低的地方作为零点；
       3.如果将过渡态能量作为零点，是否是直接写负值就行；
       3.如果将能量最低的地方作为零点，会使扫描曲线中第一个点（过渡态）的相对能量不为0，MESS中输入的能量的写法是应该以能量最低点作为第一个点来写，还是第一个点仍然写写过渡态的相对能量？
    还请各位大佬帮忙解答指正，谢谢。