gmx小分子配体蛋白质体系模拟结果蛋白质结构异常

一条空空的河 · 发表于 Post on 2024-9-13 12:12:27

如图，不知是出了什么问题，请各位大神帮忙解决！感谢！

Frozen-Penguin · 发表于 Post on 2024-9-13 12:25:58

可能是周期性边界条件的问题，原子出现在周期性盒子的两端，显示的时候直接连起来了

Loading0760 · 发表于 Post on 2024-9-13 12:35:36

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消除周期性边界条件就好了。

一条空空的河 · 发表于 Post on 2024-9-13 19:44:08

Loading0760 发表于 2024-9-13 12:35
消除周期性边界条件就好了。

谢谢！

一条空空的河 · 发表于 Post on 2024-9-13 19:44:38

Frozen-Penguin 发表于 2024-9-13 12:25
可能是周期性边界条件的问题，原子出现在周期性盒子的两端，显示的时候直接连起来了

已解决！感谢！

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[GROMACS] gmx小分子配体蛋白质体系模拟结果蛋白质结构异常