VMD如何自动旋转展示分子

xiewei · 发表于 Post on 2024-9-13 15:27:51

请问老师我用VMD看分子的时候，怎么让分子按比较慢的旋转速度旋转起来，我想绘制gif的动图，我不太清楚怎么去操作让分子旋转，有的时候点击鼠标划一下他会自己转起来，但是有的时候又没用

sobereva · 发表于 Post on 2024-9-13 15:33:38

VMD制作体系旋转和轨迹播放的gif动画的简单方法
http://sobereva.com/15

乐平 · 发表于 Post on 2024-9-14 00:43:36

本帖最后由乐平于 2024-9-14 09:30 编辑

英文输入法状态下，且鼠标点在 VMD 结构显示窗口（即让结构显示窗口是当前激活窗口的情况下），然后在键盘上按 x 就会绕着 x 轴旋转；按 y 就会绕着 y 轴旋转；按 z 就会绕着 z 轴旋转。

如果你的当前激活窗口是 VMD 主界面（换句话说，如果你仍然在主界面窗口，即导入结构的之后没有用鼠标点一下结构显示窗口），这种情况下你按键盘上任何键都没效果。

xiewei · 发表于 Post on 2024-9-14 09:57:06

乐平发表于 2024-9-14 00:43
英文输入法状态下，且鼠标点在 VMD 结构显示窗口（即让结构显示窗口是当前激活窗口的情况下），然后在键盘 ...

那请问老师这个旋转的速度怎么调节呢？

Uus/pMeC6H4-/キ · 发表于 Post on 2024-9-14 12:05:17

本帖最后由 Uus/pMeC6H4-/キ于 2024-9-14 12:20 编辑

xiewei 发表于 2024-9-14 09:57
那请问老师这个旋转的速度怎么调节呢？

按VMD手册，在VMD的命令行里输入"rock < x | y | z > by <step> <n>"（比如"rock y by 0.1"）即实现当前场景的自动旋转，输rock off可关闭。不过经过探索发现此命令不太直观，需要一些解释：

< x | y | z >三选一代表旋转轴，但是并非所加载结构的红绿蓝三色坐标轴，而是相对屏幕固定的坐标轴；
<step>代表旋转速度，但是设为1都转得有点快了，绝对值在0.2以下比较合适，而且当前是命令行窗口在前还是结构窗口在前还对应不太一样的速度；
<n>可写可不写，不写则持续一个方向旋转，写则正反两方向在一定幅度内往复旋转，但是往复旋转的角度区间并非n自己定而是n与step共同确定。

旋转方向由旋转轴和step的正负号按右手定则确定，当step为正时，右手大拇指往旋转轴方向指，其他四指自然弯曲的方向就是旋转方向。x相应于屏幕水平向右，y相应于屏幕竖直向上（与主窗口Extensions-Visualization-Movie Maker里的Movie Settings-Rotation about Y axis一致），z相应于垂直指出屏幕向外（就是指向自己）。不清楚有无可能设置别的旋转轴方向。

（右手？看着自己头像陷入沉思）

		自动登录 Automatic login	找回密码 Forget password
密码 Password			注册 Register

[建模与可视化] VMD如何自动旋转展示分子