CP2K的CI-NEB中断，如何续算？

THY · 发表于 Post on 2024-9-14 17:13:09

本帖最后由 THY 于 2024-9-14 17:16 编辑

各位大佬，小弟在使用CP2K进行过渡态搜寻的时候，任务中断，请问该如何进行续算？

计算中断后，一共输出了71个restart文件。

ChemG · 发表于 Post on 2024-9-14 17:52:28

直接运行最后一步的restart文件就行了，在这个文件里已经包含了NEB过程中的几个点的所有坐标。
小贴士：如果发现不好收敛或者能量波动，直接kill掉任务，调整最后一个restart的参数再提交就行了。

sobereva · 发表于 Post on 2024-9-14 18:34:42

把最后一个restart文件里的&REPLICA信息复制到输入文件里重新跑，就会接着之前最后一步的结构重启计算

THY · 发表于 Post on 2024-9-14 20:38:17

ChemG 发表于 2024-9-14 17:52
直接运行最后一步的restart文件就行了，在这个文件里已经包含了NEB过程中的几个点的所有坐标。
小贴士：如 ...

老师，请问该如何直接运行最后一步的restart文件

THY · 发表于 Post on 2024-9-14 20:42:15

本帖最后由 THY 于 2024-9-14 21:01 编辑

sobereva 发表于 2024-9-14 18:34
把最后一个restart文件里的&REPLICA信息复制到输入文件里重新跑，就会接着之前最后一步的结构重启计算

老师，restart文件里面有8个&REPLICA（对应我用sobNEB生成的八个副本），要全部放入inp文件里面吗？最初的inp文件里面只有1个&COORD，是用8个&REPLICA替换inp文件中的&COORD吗？还是将8个&REPLICA直接复制到inp文件的最后，其他不做修改

将8个&REPLICA复制到inp文件，报错了

sobereva · 发表于 Post on 2024-9-15 00:46:16

THY 发表于 2024-9-14 20:42
老师，restart文件里面有8个&REPLICA（对应我用sobNEB生成的八个副本），要全部放入inp文件里面吗？最初 ...

把输入文件里的&REPLICA部分替换成restart文件里的相应部分

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