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[建模与可视化] 在vesta里面O与H之前存在虚线代表什么意思?

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请教一下,几何结构优化收敛后,在vesta里面O与H之前存在虚线 ,代表什么意思?

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发表于 Post on 2023-2-19 15:42:48 | 只看该作者 Only view this author
如置顶的新社员必读贴、论坛首页的公告栏、版头的红色大字非常明确所示,求助帖必须在帖子标题明确体现出此帖内容是求助或提问,并清楚、准确反映出帖子具体内容,避免有任何歧义和含糊性,仔细看http://bbs.keinsci.com/thread-9348-1-1.html。我已把你的不恰当标题 “vesta可视化” 改了,以后务必注意
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发表于 Post on 2023-2-19 18:24:49 | 只看该作者 Only view this author
可能是氢键?

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2023-2-19 19:31:00 | 只看该作者 Only view this author

谢谢您的回复!我也认为是氢键,优化之前没有虚线存在,是O和H之间没有达到氢键的键长吗?

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发表于 Post on 2023-4-12 11:36:51 | 只看该作者 Only view this author
fight 发表于 2023-2-19 19:31
谢谢您的回复!我也认为是氢键,优化之前没有虚线存在,是O和H之间没有达到氢键的键长吗?

那个虚线应该就是表示氢键,VESTA会按照距离判定氢键。应该是优化后距离变近了,你可以量一下。

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2023-4-12 15:14:26 | 只看该作者 Only view this author
John_Tao 发表于 2023-4-12 11:36
那个虚线应该就是表示氢键,VESTA会按照距离判定氢键。应该是优化后距离变近了,你可以量一下。

好嘞谢谢!

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发表于 Post on 2024-9-24 09:24:50 | 只看该作者 Only view this author

同学,这个氢键判定标准可以修改吗?我发现有的分子内部也形成氢键,这明显不合理。

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发表于 Post on 2024-9-24 09:39:41 | 只看该作者 Only view this author
1285050231 发表于 2024-9-24 09:24
同学,这个氢键判定标准可以修改吗?我发现有的分子内部也形成氢键,这明显不合理。

图形显示阮经理的任何 “键” 其实都不是真的键,只是连接方式,当然可以任意修改。

你想修改,那么梳理一下逻辑。
1. 修改就是“编辑”,所以找到 Edit
2. 修改键,所以找 Bonds
3. 修改氢键,所以选择和氢键相关的原子,H, O 之类的,所以要点击相关的原子
4. 修改所谓的“化学键”,本质上是 “成键范围”,也就是 “原子间的距离”,所以要修改距离的数值大小

有了上述逻辑,就很好找


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