关于MS计算体系的原子数与计算机运行内存的对应关系

Yyy-materials

求助：最近发现计算的原子数过多，就会出现内存不足的失败信号，所有想问问各位专家对于要计算的体系来说，其所包含的原子数与计算机运行内存之间有没有大概的对应关系啊。

卡开发发

不好说，不同模块不一样的算法和基组甚至是数据结构对存储的复杂度不是完全一样的。MS某些模块在这点上从设计层面上说已经还算不错，在程序初始化阶段会预估一个内存需求，你可以参考这个。

Yyy-materials

卡开发发 发表于 2024-10-6 23:49
不好说，不同模块不一样的算法和基组甚至是数据结构对存储的复杂度不是完全一样的。MS某些模块在这点上从设 ...

非常感谢卡哥能够回复，经常看到卡哥的回复贴，很专业。我现在有个疑问想请教一下，我想做掺杂，然后整体架构是80个原子，掺杂后结构优化在模拟基本的性质之类的，用Windows版MS的CASTEP模块，起初运行内存是双16=32G的，在结构优化阶段，一直显示Binary file with CASTEP results not present.这个错误，我看有帖子说是内存不足，我就换了双32=64G的，但是还是一直失败，还是Binary file with CASTEP results not present.这个错误，但是运行的时候我看运存占用率也不高啊，这就让我有点摸不着头脑了，这个运行到底是吃哪一方面啊，或许我还需要增加128G吗？亦或许128也不够，需要借助运存更大的服务器？还是说我运行的时候里面的参数设置有错误吗？可能问题比较基础，还希望能够不吝赐教，谢谢！

卡开发发

Yyy-materials 发表于 2024-10-8 19:51
非常感谢卡哥能够回复，经常看到卡哥的回复贴，很专业。我现在有个疑问想请教一下，我想做掺杂，然后整体 ...

windows我不好说，因为实际上windows的系统和其他应用进程可能还得再吃掉一部分内存，你得看你运行的时候闲置的内存到底多大。是不是内存不足我不太确定，或许你可以把*.castep的文件传上来看看，这文件开始的区域也包含了需要内存的大小估计。

Yyy-materials

卡开发发 发表于 2024-10-8 19:56
windows我不好说，因为实际上windows的系统和其他应用进程可能还得再吃掉一部分内存，你得看你运行的时候 ...

已经上传运行失败的CASTEP文件了，谢谢卡哥！

卡开发发

Yyy-materials 发表于 2024-10-8 21:25
已经上传运行失败的CASTEP文件了，谢谢卡哥！

看上去没有其他问题，其实暂时判断不了。只能说如果是内存不足的问题，你可以关注这个部分：

+---------------- MEMORY AND SCRATCH DISK ESTIMATES PER PROCESS --------------+
|                                                                                Memory          Disk                     |
| Baseline code, static data and system overhead        0.0 MB         0.0 MB                  |
| BLAS internal memory storage                                  0.0 MB         0.0 MB                  |
| Model and support data                                      1149.6 MB      6335.5 MB               |
| Electronic energy minimisation requirements         903.9 MB         0.0 MB                  |
| Force calculation requirements                              117.3 MB         0.0 MB                  |
| Stress calculation requirements                              127.8 MB         0.0 MB                 |
|                                                                                            ----------------------------- |
| Approx. total storage required per process          2053.6 MB      6335.5 MB               |
|                                                                                                                                 |
| Requirements will fluctuate during execution and may exceed these estimates          |
+-----------------------------------------------------------------------------+

大概一个处理器要2G左右的内存，如果系统再吃掉一些，你看看你的内存还够不够。另外如果没有那么高的要求或许你可以试试老超软赝势，那个对动能截断需求应该没那么高，这样也许可以节约一些内存。

Yyy-materials

卡开发发 发表于 2024-10-9 03:59
看上去没有其他问题，其实暂时判断不了。只能说如果是内存不足的问题，你可以关注这个部分：

大概一个 ...

我在MS存储的磁盘又多加了100G，运存现在扩到64G后，运行时占用率也就在20%左右，现在都还空余很多，那我再试一下老超软赝势看看。另外卡哥，我再附上一个显示运行错误的截图，不知道有没有用

卡开发发

Yyy-materials 发表于 2024-10-9 10:39
我在MS存储的磁盘又多加了100G，运存现在扩到64G后，运行时占用率也就在20%左右，现在都还空余很多，那我 ...

那我就不太清楚，或许并不是内存问题，但这里应该是没有信息可以判断了。

Yyy-materials

卡开发发 发表于 2024-10-9 12:55
那我就不太清楚，或许并不是内存问题，但这里应该是没有信息可以判断了。

好嘞，非常感谢卡哥！ 受益匪浅！我在试一下看看有没有其他信息。