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[新手求助] 求助利用ORCA+Multiwfn生成小分子的RESP原子电荷的问题

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楼主
新手求助:
利用 ORCA+Multiwfn 生成小分子的 RESP 原子电荷

将Multiwfn目录下的examples\RESP\目录下的RESP_ORCA.sh拷到当前目录,使用chmod +x ./RESP_ORCA.sh给它增加可执行权限。把含有分子结构信息的文件也拷到当前目录,格式是mol2。然后运行下面的命令:
./RESP_ORCA.sh JZ4.mol2

结果:Net charge was not defined. Default to 0
Spin multiplicity was not defined. Default to 1
Solvent name was not defined. Default to water
./RESP_ORCA.sh: line 58: Multiwfn: command not found
awk: fatal: cannot open file `tmp.xyz' for reading (No such file or directory)
rm: cannot remove 'tmp.xyz': No such file or directory
Running optimization task via ORCA...
[file orca_tools/Tool-Misc/qccc2ic.cpp, line 640]: No atoms to convert in Cartesian2Internal

The optimization task has failed! Please check content of opt.out to find reason
The script is terminated
rm: cannot remove 'opt_*': No such file or directory

已经在环境变量path中添加路径,为什么还出现
Multiwfn: command not found?



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发表于 Post on 2022-6-23 14:21:04 | 只看该作者 Only view this author
你有没有打开RESP_ORCA.sh这个脚本,把这两行红色改成实际路径
#Set actual paths of ORCA and orca_2mkl utility here
ORCA="/sob/orca503/orca"
orca_2mkl="/sob/orca503/orca_2mkl"
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2022-6-23 14:24:39 | 只看该作者 Only view this author
牧生 发表于 2022-6-23 14:21
你有没有打开RESP_ORCA.sh这个脚本,把这两行红色改成实际路径
#Set actual paths of ORCA and orca_2mkl  ...

ORCA="E:/orca502/orca"
orca_2mkl="‪E:/orca502/orca_2mkl"

您好,我想问下,这是不是改的不对啊

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发表于 Post on 2022-6-23 14:34:29 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 牧生 于 2022-6-23 14:35 编辑
angelhunte 发表于 2022-6-23 14:24
ORCA="E:/orca502/orca"
orca_2mkl="‪E:/orca502/orca_2mkl"

http://bbs.keinsci.com/thread-28178-1-1.html

第一句话就划了重点,linux
  1. 之前笔者在以下文章中提供了三个Linux shell脚本
复制代码
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2022-6-23 14:49:38 | 只看该作者 Only view this author
牧生 发表于 2022-6-23 14:34
http://bbs.keinsci.com/thread-28178-1-1.html

第一句话就划了重点,linux

知道了,谢谢~

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发表于 Post on 2022-6-23 15:42:50 | 只看该作者 Only view this author

装个cmder或者wsl,windows系统也可以

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发表于 Post on 2022-6-23 19:04:19 | 只看该作者 Only view this author
看Multiwfn手册2.1.2节了解怎么在Linux里装Multiwfn

在cmder提供的Bash环境里调用windows版的ORCA和Multiwfn也可以,前提是相应可执行文件路径都写对
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Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
Google Scholar:https://scholar.google.com/citations?user=tiKE0qkAAAAJ
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu

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发表于 Post on 2024-10-17 10:40:42 | 只看该作者 Only view this author
牧生 发表于 2022-6-23 14:21
你有没有打开RESP_ORCA.sh这个脚本,把这两行红色改成实际路径
#Set actual paths of ORCA and orca_2mkl  ...

老师,您好,我在用RESP方法计算电荷时,RESP_orca.sh的路径也改了,系统也是linux系统,但还是出现了和贴主一样的问题,Multiwfn和ORCA都可以正常使用,请问有什么办法可以解决?

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