求助: 采用cp2k进行aimd, 这速度正常吗？

Ron3319 · 发表于 Post on 2024-10-28 03:50:30

本帖最后由 Ron3319 于 2024-10-28 11:43 编辑

大家家，小弟刚开始用cp2k，目前在做64个CO2在400K时的计算。基组为DZVP-MOLOPT-SR-GTH，CUTOFF为300Ry，REL_CUTOFF为40 Ry。

Pair Potential:
Type DFTD3
REFERENCE FUNCTIONAL PBE

这计算已进行了36小时，但只跑了1604fs。请问这速度正常吗？是否有些多余的或不当设定在inp文件中？我已用了Multiwfn，很多设定也是内设的。

文件已附在这帖中。

hulei · 发表于 Post on 2024-10-28 10:03:10

CUTOFF设那么高肯定慢，300-400就可以了

Ron3319 · 发表于 Post on 2024-10-28 10:25:26

hulei 发表于 2024-10-28 10:03
CUTOFF设那么高肯定慢，300-400就可以了

多谢回复，我的设置是300Ry，我在帖子裹写错，已修正了

Uus/pMeC6H4-/キ · 发表于 Post on 2024-10-28 10:59:14

本帖最后由 Uus/pMeC6H4-/キ于 2024-10-28 11:09 编辑

vdw-df3是泛函还是色散校正？从&XC字段看明明用的是PBE泛函搭配DFT-D3色散校正。（包括隔壁的http://bbs.keinsci.com/thread-49345-1-1.html也有这个问题）

初始结构是怎么生成的，有没有做几何优化和预平衡？（编辑：不好意思搞混了两个帖的输入文件，此处删掉了一些内容）

另外，讨论计算速度而不讲计算资源分配没啥意义，得具体说这个任务用了多少CPU核心、分了几个进程线程来并行。以及指明CP2K版本。

Ron3319 · 发表于 Post on 2024-10-28 11:41:01

Uus/pMeC6H4-/キ发表于 2024-10-28 10:59
vdw-df3是泛函还是色散校正？从&XC字段看明明用的是PBE泛函搭配DFT-D3色散校正。（包括隔壁的http://bbs.ke ...

多谢提醒

初始结构是用packmol生成, 生成后就用cp2k跑AIMD。

nodes = 1, ntasks = 16 (number of MPI processes)

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[CP2K] 求助: 采用cp2k进行aimd, 这速度正常吗？