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[Molpro] 分享 C4H4 的过渡态优化经验

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本帖最后由 王二葛 于 2022-11-24 15:08 编辑

听闻师兄讲到了 C4H4(环丁二烯)的稳定结构非正方形,我想它从扁长 ▄ 变成瘦长 ▌的过程中理应有过渡态

1. Gaussian 16
a) 手动调整成正方形,令 C-C 键长 = 1.456 Ang
b) 从简单 b3lyp/6-31g* 开始,直接优化过渡态 opt(ts, calcfc)  -> 失败,提示无虚频
c) 用 QST2,提供两端的结构 -> 失败,几何优化震荡后停在某稳定构型
d) 升级泛函到 ωB97XD、M06-2X,升级基组到 cc-pVTZ,搭配 guess=mix -> 均失败,同上
e) 扫描 2d 势能面,确认在 b3lyp/6-31g* 是有过渡态的

2. Molpro 做多参考
a) 挑轨道,认为 cas(4,4) 足以描述
b) 用 MOKit 的 automr 计算 CASSCF(4,4),选择 CASSCF 程序为 molpro -> 成功收敛
c) 在 automr 产生的 Molpro 输入文件中,增加 cpmcscf,hess 计算解析梯度、增加 optg,root=2 优化过渡态、增加 frequencies 输出频率 -> 成功
d) 用 Chemcraft 可视化频率,可看到指向两种稳定构型的振动

附 cas(4,4) 优化后的过渡态:
C          0.0000000000        0.7235864513        0.7235864507
C          0.0000000000       -0.7235864515       -0.7235864509
C          0.0000000000       -0.7235864506        0.7235864509
C          0.0000000000        0.7235864508       -0.7235864511
H          0.0000000000        1.4857993357       -1.4857993351
H          0.0000000000       -1.4857993358       -1.4857993355
H          0.0000000000       -1.4857993350        1.4857993353
H          0.0000000000        1.4857993351        1.4857993358



请老师指导,为何 DFT 和双杂化都优化不出过渡态?


十八介姑娘一蕾花呀,白白介牙齿、红红介嘴唇,得人惜

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发表于 Post on 2022-11-24 15:14:11 | 只看该作者 Only view this author
因为过渡态处多参考态性质极强,DFT势能面定性错误。
对C-C键长做个二维扫描就能看出这一点了
Zikuan Wang
山东大学光学高等研究中心 研究员
BDF(https://bdf-manual.readthedocs.io/zh_CN/latest/Introduction.html)、ORCA(https://orcaforum.kofo.mpg.de/index.php)开发团队成员
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发表于 Post on 2022-11-25 01:18:48 | 只看该作者 Only view this author
可以通过对称破缺计算得到TS,还能跑IRC




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王二葛 + 5 牛!谢谢 PhD Sob 的新讲义

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发表于 Post on 2025-4-3 19:03:06 | 只看该作者 Only view this author
wzkchem5 发表于 2022-11-24 15:14
因为过渡态处多参考态性质极强,DFT势能面定性错误。
对C-C键长做个二维扫描就能看出这一点了

你好老师想请教一下 您所说的对C-C键长做二维扫描是指对两对对称的C-C做二维扫描 比如对C-C1:1.3埃-1.6埃变化  C-C2:1.6-1.3 变化做柔性扫描来得到包含各个键长的D2h-D4h-D2h构型转化过程 这样扫描可以看出其定性错误么;还是需要改变一下我上述的方法 。我尝试上述方法取了一些点构型(大概108个)在b3lyp 6-31g(d)下单独做优化得到的能量势能面走势似乎也是能表现出存在鞍点的 对称的两个D2h构型能量相似,到D4h构型能量会升高,在D4h构型的曲线上存在极小点 所以最终呈现的势能面显示也是存在鞍点过渡态的 。所以想请教一下是不是上述计算存在问题 该如何才能显示出dft会将C4H4的势能面定性错误 谢谢!

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发表于 Post on 2025-4-3 20:26:49 | 只看该作者 Only view this author
XingXing09 发表于 2025-4-3 19:03
你好老师想请教一下 您所说的对C-C键长做二维扫描是指对两对对称的C-C做二维扫描 比如对C-C1:1.3埃-1.6 ...

关键要看过渡态处势能面是否可导。DFT扫出的势能面应当在D4h结构处不可导
Zikuan Wang
山东大学光学高等研究中心 研究员
BDF(https://bdf-manual.readthedocs.io/zh_CN/latest/Introduction.html)、ORCA(https://orcaforum.kofo.mpg.de/index.php)开发团队成员
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ORCID: https://orcid.org/0000-0002-4540-8734
主页:http://www.qitcs.qd.sdu.edu.cn/info/1034/1702.htm
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发表于 Post on 2025-4-3 23:51:29 | 只看该作者 Only view this author
wzkchem5 发表于 2025-4-3 20:26
关键要看过渡态处势能面是否可导。DFT扫出的势能面应当在D4h结构处不可导

那这个是否可导可以如何体现呢 单通过图像来看的话应该是不可以的吧

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发表于 Post on 2025-4-4 07:20:59 | 只看该作者 Only view this author
XingXing09 发表于 2025-4-3 23:51
那这个是否可导可以如何体现呢 单通过图像来看的话应该是不可以的吧

势能面不可导就是说势能面是尖的
现代化学以狄拉克的一句“一切化学问题业已解决”为嚆矢。滥觞于经验主义传统的期望正失去它们的借鉴意义。但面对看似不可达的通往天堂之阶梯,我想循伍德沃德“最好的模型是你底物的对映异构体”的信仰好过过早地振翮。
我们怀揣热忱的灵魂天然被赋予对第一性的追求,不屑于单一坐标的约束,钟情于势能面彼端的芬芳。但

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发表于 Post on 2025-4-7 11:43:27 | 只看该作者 Only view this author
北大-陶豫 发表于 2025-4-4 07:20
势能面不可导就是说势能面是尖的

明白您意思了 谢谢!

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