求助一个非手性分子计算ECD光谱前是否需要进行构象搜索

milliliter · 发表于 Post on 2025-3-29 00:34:28

在计算一个非手性分子的ECD时，计算出来的ECD光谱显示存在手性，想知道是否是因为没有进行构象搜索，也想了解一下是否所有分子（手性与非手性）用guass计算ECD谱前都需要进行构象搜索，求各位老师解答。

zsu007 · 发表于 Post on 2025-3-29 09:04:07

ECD一般来说都需要考虑不同构象、温度、溶剂等的影响，系统搜索分子的构象，对比考虑构象和不考虑构象这两种方法做出的ECD是否有很大差异来说明问题。

milliliter · 发表于 Post on 2025-3-29 20:40:39

zsu007 发表于 2025-3-29 09:04
ECD一般来说都需要考虑不同构象、温度、溶剂等的影响，系统搜索分子的构象，对比考虑构象和不考虑构象这两 ...

谢谢老师解答，我去对比一下。

Accelerator · 发表于 Post on 2025-3-29 20:55:20

单一构象当然有手性，除非恰好取了一个带有对称元素的极端个例。宏观分子没手性是由于通过化学键旋转的消旋能垒远低于热运动极限。

sobereva · 发表于 Post on 2025-3-29 23:15:57

别乱拼Gaussian

ECD对构象极其敏感，有易旋转的键的手性分子算ECD前不做构象搜索完全不能接受，极有可能定性错误。参考下文
使用Multiwfn绘制构象权重平均的光谱
http://sobereva.com/383（http://bbs.keinsci.com/thread-6186-1-1.html）

milliliter · 发表于 Post on 2025-3-30 19:54:21

Accelerator 发表于 2025-3-29 20:55
单一构象当然有手性，除非恰好取了一个带有对称元素的极端个例。宏观分子没手性是由于通过化学键旋转的消旋 ...

谢谢老师解答

milliliter · 发表于 Post on 2025-3-30 19:55:24

sobereva 发表于 2025-3-29 23:15
别乱拼Gaussian

ECD对构象极其敏感，有易旋转的键的手性分子算ECD前不做构象搜索完全不能接受，极有可能 ...

谢谢sob老师，我去学习一下

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