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[GROMACS] 如何制作甲基化的DNA残基

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本帖最后由 不知去向的小狼 于 2023-1-10 23:34 编辑

各位老师,本人的需求是将DNA上的单个DC甲基化,本人的做法是将DC的H6换成甲基基团(类似DT的C7,H71,H72,H73),我制作了甲基化后的力场文件 methly.txt (1.96 KB, 下载次数 Times of downloads: 15)
并且将其放入amber99sb-ildn力场下的dna.itp,但是出现了segment fault请问怎样正确的修改DNA力场以放入自己修改的残基?


A single pale rose

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2#
发表于 Post on 2023-1-12 06:03:32 | 只看该作者 Only view this author
在原有基础上,一次只改一点,反复对比和测试
并且如果用的windows版,改成linux版再试
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