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[Gaussian/gview] 求助,BSSE计算相互作用能

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请问一下各位老师,如果我的体系中存在三个片段。我想考察片段1和片段2的相互作用能量,我可以把优化后的结构中的片段3删去,只用片段1和2算相互作用能么。
如果不能的话,在BSSE方法中定义了三个片段,最后得到的complexation energy指的是什么呢?我应该怎么得到1和2之间的相互作用能。

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发表于 Post on 2021-8-19 22:30:46 | 只看该作者 Only view this author
三个片段的体系里某两个片段的相互作用能没有唯一定义。算是可以算,但是你要确定你想算哪种相互作用能,比如你是否希望,1和2的作用能+2和3的作用能+3和1的作用能 = 总作用能?还是希望在算1和2的作用能的时候完全排除掉3的影响?这两者是不可兼得的
Zikuan Wang
山东大学光学高等研究中心 研究员
BDF(https://bdf-manual.readthedocs.io/zh_CN/latest/Introduction.html)、ORCA(https://orcaforum.kofo.mpg.de/index.php)开发团队成员
Google Scholar: https://scholar.google.com/citations?hl=zh-CN&user=XW6C6eQAAAAJ&view_op=list_works&sortby=pubdate
ORCID: https://orcid.org/0000-0002-4540-8734
主页:http://www.qitcs.qd.sdu.edu.cn/info/1034/1702.htm
本团队长期招收研究生,有意者可私信联系

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发表于 Post on 2021-8-20 06:53:19 | 只看该作者 Only view this author
你当前这个问题和BSSE并没有任何直接关系。搞清楚BSSE到底是什么,有什么方式可以解决BSSE,不要用什么“BSSE方法”这种明显错误的用词
仔细看此文
谈谈BSSE校正与Gaussian对它的处理
http://sobereva.com/46

不能简单地把三聚体中两个单体拿出来当二聚体计算,否则顶多是体现了另一个单体对复合物结构的影响,而并没有体现它对这两个单体电子结构的影响。

参考北京科音中级量子化学培训班(http://www.keinsci.com/KBQC)幻灯片:
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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发表于 Post on 2025-5-16 14:34:44 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2021-8-20 06:53
你当前这个问题和BSSE并没有任何直接关系。搞清楚BSSE到底是什么,有什么方式可以解决BSSE,不要用什么“BS ...

sob老师,讲义中涉及到的这些结构都需要分别优化还是直接从优化完的[ABC]复合物结构中扣出来算能量就行?

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发表于 Post on 2025-5-16 15:51:26 | 只看该作者 Only view this author
Dyyyzz 发表于 2025-5-16 14:34
sob老师,讲义中涉及到的这些结构都需要分别优化还是直接从优化完的[ABC]复合物结构中扣出来算能量就行?

要重新优化
路漫漫其修远兮,吾将上下而求索

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发表于 Post on 2025-5-17 04:36:50 | 只看该作者 Only view this author
Dyyyzz 发表于 2025-5-16 14:34
sob老师,讲义中涉及到的这些结构都需要分别优化还是直接从优化完的[ABC]复合物结构中扣出来算能量就行?

直接抠出来,不要重新优化

这里算的是相互作用,和结合能是两码事,看下文了解区别
谈谈分子间结合能的构成以及分解分析思想
http://sobereva.com/733http://bbs.keinsci.com/thread-50890-1-1.html
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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