计算化学公社

 找回密码 Forget password
 注册 Register
Views: 4607|回复 Reply: 6
打印 Print 上一主题 Last thread 下一主题 Next thread

[Linux] 安装opemmpi-3.1.4出错

[复制链接 Copy URL]

147

帖子

0

威望

2408

eV
积分
2555

Level 5 (御坂)

本帖最后由 yaochuang 于 2019-9-17 18:01 编辑

      请教各位老师,我在安装opemmpi-3.1.4时出现如下错位,请问这是什么原因呢?我的系统是Centos7,gcc,C++等都是最新的版本。

3814

帖子

4

威望

8005

eV
积分
11899

Level 6 (一方通行)

MOKIT开发者

2#
发表于 Post on 2019-9-17 19:10:16 | 只看该作者 Only view this author
最好能给出编译命令。

另外,如果用了多核编译make -jN,试试用单核编译看看。
自动做多参考态计算的程序MOKIT

147

帖子

0

威望

2408

eV
积分
2555

Level 5 (御坂)

3#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2019-9-17 20:39:23 | 只看该作者 Only view this author
zjxitcc 发表于 2019-9-17 19:10
最好能给出编译命令。

另外,如果用了多核编译make -jN,试试用单核编译看看。

我使用的编译命令是:
./configure --prefix=/admin/openmpi314 --disable-builtin-atomics
make all install -j
去掉-j,使用单核编译也是一样的结果,configure的结果是正常结束的。

3814

帖子

4

威望

8005

eV
积分
11899

Level 6 (一方通行)

MOKIT开发者

4#
发表于 Post on 2019-9-17 20:45:33 | 只看该作者 Only view this author
yaochuang 发表于 2019-9-17 20:39
我使用的编译命令是:
./configure --prefix=/admin/openmpi314 --disable-builtin-atomics
make all in ...

用intel编译器试试看呢./configure --prefix=... CC=icc CXX=icpc FC=ifort F77=ifort
自动做多参考态计算的程序MOKIT

1187

帖子

5

威望

2841

eV
积分
4129

Level 6 (一方通行)

5#
发表于 Post on 2019-9-18 00:17:02 | 只看该作者 Only view this author
centos上gcc不要轻易升级到最新版比较好吧,您试试gcc 5.4.0行不行

5万

帖子

99

威望

5万

eV
积分
112499

管理员

公社社长

6#
发表于 Post on 2019-9-18 18:19:52 | 只看该作者 Only view this author
检查~/.bashrc等地方,看看是否有可能一些乱七八糟配置干扰。有可能碍事的全都给注释掉。然后重新进入shell。然后把openmpi目录删了,重新解压一遍,装的时候不用-j再试

用过CentOS好几个版本,从来没遇到过基于gcc编译openmpi有问题的
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入“北京科音”微信公众号获取北京科音培训的最新消息、避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气非常高、专业性特别强的综合性理论与计算化学交流QQ群“思想家公社QQ群”:1号:18616395,2号:466017436,3号:764390338,搜索群号能搜到哪个说明目前哪个能加,合计9000人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大的量子化学波函数分析程序)
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu
Money and papers are rubbish, get a real life!

147

帖子

0

威望

2408

eV
积分
2555

Level 5 (御坂)

7#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2019-9-19 08:31:33 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2019-9-18 18:19
检查~/.bashrc等地方,看看是否有可能一些乱七八糟配置干扰。有可能碍事的全都给注释掉。然后重新进入shell ...

谢谢sob老师,最后使用./configure --prefix=/home/yaochuang/software/openmpi314 --disable-builtin-atomics --without-ucx 编译成功了,可以运行ORCA并行,不知道这个ucx是干啥用了的。

本版积分规则 Credits rule

手机版 Mobile version|北京科音自然科学研究中心 Beijing Kein Research Center for Natural Sciences|京公网安备 11010502035419号|计算化学公社 — 北京科音旗下高水平计算化学交流论坛 ( 京ICP备14038949号-1 )|网站地图

GMT+8, 2024-11-27 14:04 , Processed in 0.385845 second(s), 24 queries , Gzip On.

快速回复 返回顶部 返回列表 Return to list